Wilkinson, Mark Denis mark.wilkinson@upm.es
Actividades
- Artículos 86
- Libros 0
- Capítulos de libro 4
- Congresos 45
- Documentos de trabajo 1
- Informes técnicos 0
- Proyectos de investigación 14
- Tesis dirigidas 5
- Patentes o licencias de software 2
The FAIR journey of a patient-driven registry: Reflections and practical solutions from the Duchenne Data Platform FAIRification experience
- Lalout, Nawel
- Wilkinson, Mark D
- Wandrei, Dagmar
- Tassoni, Adrian
- Atalaia, Antonio
- Prieto, Mario
- Camara, Alberto
- Quemada, Eduardo
- Franken, Mirjam
- Jonker, Anneliene H
- Paliouras, Georgios
- Siminiuc, Sergiu
- Carta, Claudio
- Dos Santos Vieira, Bruna
- Roos, Marco
- Kaliyaperumal, Rajaram
- Evangelista, Teresinha
- Hoen, Peter A C 't
- Vroom, Elizabeth
J Neuromuscul Dis (p. 304-315) - 1/5/2026
10.1177/22143602251382969 Ver en origen
- ISSN 22143599
SIMPATHIC: Accelerating drug repurposing for rare diseases by exploiting SIMilarities in clinical and molecular PATHology
- van Karnebeek, Clara D M
- Muller, Annelieke R
- Benkemoun, Laura
- Boussaad, Ibrahim
- Cornel, Martina C
- Inthout, Joanna
- de Kort, Martin
- Martins, Sofia de Oliveira
- Prigione, Alessandro
- Rigter, Tessel
- Roes, Kit C B
- Sanchez, Anna
- Schipper, Raymond
- Wilkinson, Mark D
- 't Hoen, Peter A C
Molecular Genetics And Metabolism - 13/3/2025
10.1016/j.ymgme.2025.109073 Ver en origen
- ISSN 10967192
Brassica rapa CURLY LEAF is a major H3K27 methyltransferase regulating flowering time
- Poza-Viejo, Laura
- Paya-Milans, Miriam
- Wilkinson, Mark D
- Pineiro, Manuel
- Jarillo, Jose A
- Crevillen, Pedro
Planta - 1/7/2024
10.1007/s00425-024-04454-7 Ver en origen
- ISSN 00320935
Common conditions of use elements. Atomic concepts for consistent and effective information governance
- Gonzalez, Maria del Carmen Sanchez
- Kamerling, Pim
- Iermito, Mariapia
- Casati, Sara
- Riaz, Umar
- Veal, Colin D
- Maini, Monika
- Jeanson, Francis
- Benhamed, Oussama Mohammed
- van Enckevort, Esther
- Landi, Annalisa
- Mimouni, Yanis
- Le Cornec, Clemence
- Coviello, Domenico A
- Franchin, Tiziana
- Fusco, Francesca
- Garcia, Jose Antonio Ramirez
- van der Zanden, Loes F M
- Bernier, Alexander
- Wilkinson, Mark D
- Mueller, Heimo
- Gibson, Spencer J
- Brookes, Anthony J
Scientific Data - 8/5/2024
- ISSN 20524463
Getting your DUCs in a row - standardising the representation of Digital Use Conditions
- Jeanson, Francis
- Gibson, Spencer J
- Alper, Pinar
- Bernier, Alexander
- Woolley, J Patrick
- Mietchen, Daniel
- Strug, Andrzej
- Becker, Regina
- Kamerling, Pim
- Gonzalez, Maria del Carmen Sanchez
- Mah, Nancy
- Novakowski, Ann
- Wilkinson, Mark D
- Benhamed, Oussama Mohammed
- Landi, Annalisa
- Krog, Georg Philip
- Mueller, Heimo
- Riaz, Umar
- Veal, Colin
- Holub, Petr
- van Enckevort, Esther
- Brookes, Anthony J
Scientific Data - 8/5/2024
- ISSN 20524463
Building Expertise on FAIR Through Evolving Bring Your Own Data (BYOD) Workshops: Describing the Data, Software, and Management-focused Approaches and Their Evolution
- Bernabe, Cesar H
- Thielemans, Lieze
- Kaliyaperumal, Rajaram
- Carta, Claudio
- Zhang, Shuxin
- van Gelder, Celia W G
- Benis, Nirupama
- Santos, Luiz Olavo Bonino da Silva
- Cornet, Ronald
- Vieira, Bruna dos Santos
- Lalout, Nawel
- Henriques, Ines
- Ballesteros, Alberto Camara
- Burger, Kees
- Kersloot, Martijn G
- Ehrhart, Friederike
- van Enckevort, Esther
- Evelo, Chris T
- Gray, Alasdair J G
- Hanauer, Marc
- Hettne, Kristina
- de Ligt, Joep
- Pereira, Arnaldo
- Queralt-Rosinach, Nuria
- Schultes, Erik
- Taruscio, Domenica
- Waagmeester, Andra
- Wilkinson, Mark D
- Willighagen, Egon L
- Jansen, Mascha
- Mons, Barend
- Roos, Marco
- Jacobsen, Annika
Data Intelligence (p. 429-456) - 1/5/2024
10.1162/dint_a_00236 Ver en origen
- ISSN 2641435X
FAIR Header Reference genome: a TRUSTworthy standard
- Wright, Adam
- Wilkinson, Mark D
- Mungall, Christopher
- Cain, Scott
- Richards, Stephen
- Sternberg, Paul
- Provin, Ellen
- Jacobs, Jonathan L
- Geib, Scott
- Raciti, Daniela
- Yook, Karen
- Stein, Lincoln
- Molik, David C
Briefings In Bioinformatics - 27/3/2024
10.1093/bib/bbae122 Ver en origen
- ISSN 14675463
EURO-NMD registry: federated FAIR infrastructure, innovative technologies and concepts of a patient-centred registry for rare neuromuscular disorders
- Atalaia, Antonio
- Wandrei, Dagmar
- Lalout, Nawel
- Thompson, Rachel
- Tassoni, Adrian
- 't Hoen, Peter A C
- Athanasiou, Dimitrios
- Baker, Suzie-Ann
- Sakellariou, Paraskevi
- Paliouras, Georgios
- D'Angelo, Carla
- Horvath, Rita
- Mancuso, Michelangelo
- van der Beek, Nadine
- Kornblum, Cornelia
- Kirschner, Janbernd
- Pareyson, Davide
- Bassez, Guillaume
- Blacas, Laura
- Jacoupy, Maxime
- Eng, Catherine
- Lamy, Francois
- Plancon, Jean-Philippe
- Haberlova, Jana
- Brusse, Esther
- Hoeijmakers, Janneke G J
- de Visser, Marianne
- Claeys, Kristl G
- Paradas, Carmen
- Toscano, Antonio
- Silani, Vincenzo
- Gyenge, Melinda
- Reviers, Evy
- Hamroun, Dalil
- Vroom, Elisabeth
- Wilkinson, Mark D
- Lochmuller, Hanns
- Evangelista, Teresinha
Orphanet Journal Of Rare Diseases - 14/2/2024
10.1186/s13023-024-03059-3 Ver en origen
- ISSN 17501172
The FLAIR-GG federated network of FAIR germplasm data resources
- Ballesteros, Alberto Camara
- Jara, Elena Aguayo
- Verykaki, Evrykleia Sofia
- del Olmo, German Pastor
- Vazquez, Santiago Moreno
- Torres, Elena
- Wilkinson, Mark D
Scientific Data - 18/12/2024
10.1038/s41597-024-04243-7 Ver en origen
- ISSN 20524463
Testing the stress gradient hypothesis in soil bacterial communities associated with vegetation belts in the Andean Atacama Desert
- Mandakovic, Dinka
- Aguado-Norese, Constanza
- Garcia-Jimenez, Beatriz
- Hodar, Christian
- Maldonado, Jonathan E
- Gaete, Alexis
- Latorre, Mauricio
- Wilkinson, Mark D
- Gutierrez, Rodrigo A
- Cavieres, Lohengrin A
- Medina, Joaquin
- Cambiazo, Veronica
- Gonzalez, Mauricio
Environmental Microbiomes - 28/3/2023
10.1186/s40793-023-00486-w Ver en origen
- ISSN 25246372
Este/a investigador/a no tiene libros.
Web Services and the Semantic Web for Life Science Data
- Kothari CR
- Wilkinson MD
Encyclopedia Of Database Systems: Second Edition (p. 4669-4677) - 1/1/2018
Biological Resource Discovery
Encyclopedia Of Database Systems: Second Edition (p. 283-287) - 1/1/2018
Biological Metadata Management
- Lacroix Z
- Kothari CR
- Mork P
- Wilkinson MD
- Cohen-Boulakia S
Encyclopedia Of Database Systems: Second Edition (p. 277-282) - 1/1/2018
Seminario extraordinario IdISSC: FAIR implementation: tools, triumphs, and turmoil
- WILKINSON, MARK DENIS (Autor o Coautor)
1/1/2025
- iMarina
FAIR Implementation: Tools, Triumphs, and Tribulations
- WILKINSON, MARK DENIS (Autor o Coautor)
1/1/2025
- iMarina
Introduction to FAIR Data
- WILKINSON, MARK DENIS (Autor o Coautor)
Bad Honnef Seminar 2025: “Opportunities and Challenges of FAIR Data at Photon and Neutron Facilities” - 1/1/2025
- iMarina
FAIR principles: from seed supermarkets to germplasm data centers
- Cámara A
- Moreno S
- Wilkinson MD
CEUR Workshop Proceedings - 1/1/2025
- ISSN 16130073
- iMarina
Take CARE of your patient data. Clinical And Registry Entries (CARE) Semantic Model
- Alarcón-Moreno P
- Wilkinson MD
Ceur Workshop Proceedings (p. 116-123) - 1/1/2024
- ISSN 16130073
- iMarina
Surveyed common data access policies preferences amongst European Reference Networks
- Cámara A
- Benis N
- Bernabé CH
- Coelho IDO
- Le Cornec CMA
- Demir A
- Vieira BDS
- Ramírez JA
- van der Velde KJ
- Zhang S
- Cornet R
- Jacobsen A
- Roos M
- Schaefer F
- Swertz MA
- Wilkinson MD
Ceur Workshop Proceedings (p. 107-111) - 1/1/2023
- ISSN 16130073
- iMarina
Reuse of Design Pattern Measurements for Health Data
- Queralt-Rosinach N
- Wilkinson M
- Kaliyaperumal R
- Bernabé CH
- Long Q
- Dumontier M
- Schofield PN
- Roos M
Ceur Workshop Proceedings - 11/9/2021
10.17863/cam.77969 Ver en origen
- ISSN 16130073
- iMarina
- iMarina
Modeling recovery of Crohn's disease, by simulating microbial community dynamics under perturbations
- Muriel
- Jorge Carrasco
- García-Jiménez
- Beatriz
- Wilkinson
- Mark D
Ismb-Eccb 2019 (p. 36-36) - 21/7/2019
Condensed Microbiome representation using Transfer and Deep Learning to Promote Microbial Composition Prediction
- Sara Cabello
- WILKINSON, MARK DENIS
- Garcia Jimenez, Beatriz
Advances Incomputational Biology fostering Collaborationamong Women Scientists book Of Abstracts (p. 78-78) - 28/11/2019
- iMarina
Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.
CONSULTING, TRAINING, AND TECHNOLOGY DEVELOPMENT FOR FAIRIFICATION PROJECTS RUN BY FAIR DATA SYSTEMS
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-12-2025 - 30-11-2026
Tipo: Interno
Importe financiado: 0,00 Euros.
- iMarina
ERDERA: European Rare Disease Research Alliance
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: Desde 12-10-2025
- iMarina
Open Science Plan-Track-Assess Pathways
- ALARCON MORENO, PABLO (Participante)
- Corcho García, Oscar (Investigador principal (IP))
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-02-2024 - 31-01-2027
Tipo: Internacional
Importe financiado: 349375,00 Euros.
- iMarina
PAPEL DE LAS INFECCIONES MÚLTIPLES EN EL RIESGO DE INFECCIÓN DE PLANTAS POR VIRUS
- ZAMFIR VELEA, ADRIAN DANUT (Miembro del equipo de trabajo)
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
- GARCIA-ARENAL RODRIGUEZ, FERNANDO (Investigador principal (IP))
- ALARCON MORENO, PABLO (Miembro del equipo de trabajo)
- CAMARA BALLESTEROS, ALBERTO (Miembro del equipo de trabajo)
- BABALOLA, BISOLA MERCY (Miembro del equipo de trabajo)
- DE ANDRES TORAN, RAFAEL (Miembro del equipo de trabajo)
Ejecución: 01-09-2022 - 31-08-2025
Tipo: Nacional
- iMarina
FAIRificación", conexión y reutilización integrada de recursos fitogenéticos conservados ex-situ
- ALARCON MORENO, PABLO (Miembro del equipo de trabajo)
- CAMARA BALLESTEROS, ALBERTO (Miembro del equipo de trabajo)
- MORENO VAZQUEZ, SANTIAGO (Investigador principal (IP))
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-12-2022 - 30-11-2024
Tipo: Nacional
Importe financiado: 122705,00 Euros.
- iMarina
Acreditación Centros de Excelencia Severo Ochoa
- CARRASCO LOPEZ, PETERSON CRISTIAN (Miembro del equipo de trabajo)
- ARMAS ALVAREZ, ALEJANDRO MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- SEYLLER ALVARADO, AARON (Miembro del equipo de trabajo)
- DEL POZO BENITO, JUAN CARLOS (Miembro del equipo de trabajo)
- Wabnik, Anna Barbara (Miembro del equipo de trabajo)
- MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO (Miembro del equipo de trabajo)
- Castellano Moreno, Mar (Miembro del equipo de trabajo)
- Diaz Perales, Araceli (Miembro del equipo de trabajo)
- WABNIK, KRZYSZTOF (Miembro del equipo de trabajo)
- COUCE IGLESIAS, ALEJANDRO (Miembro del equipo de trabajo)
- ABELENDA VILA, JOSE ANTONIO (Miembro del equipo de trabajo)
- CARO BERNAT, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- ARMAS, ALEJANDRO MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- CUTUGNO, LAURA (Miembro del equipo de trabajo)
- Perez Alonso, Marta Marina (Miembro del equipo de trabajo)
- PONZ ASCASO, FERNANDO (Miembro del equipo de trabajo)
- HOANG VAN, CUONG (Miembro del equipo de trabajo)
- LOPEZ GARCIA, ADRIAN (Miembro del equipo de trabajo)
- MONTOLIU NERIN, MERCE (Miembro del equipo de trabajo)
- VICENTE CARBAJOSA, JESUS (Miembro del equipo de trabajo)
- PATEL, MANISH KUMAR (Miembro del equipo de trabajo)
- SACRISTAN BENAYAS, SOLEDAD (Miembro del equipo de trabajo)
- PALACIOS ALBERTI, JOSE MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- DE, AISHEE (Miembro del equipo de trabajo)
- PAGAN MUÑOZ, JESUS ISRAEL (Miembro del equipo de trabajo)
- POLLMANN, STEPHAN (Miembro del equipo de trabajo)
- GARRIDO ARANDIA, MARIA (Miembro del equipo de trabajo)
- MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL (Miembro del equipo de trabajo)
- GONZALEZ GUERRERO, MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- SÁNCHEZ VALLET, ANDREA (Miembro del equipo de trabajo)
- ECHAVARRI ERASUN, CARLOS (Miembro del equipo de trabajo)
- JORDA MIRO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
- DUNGER, RICARDO GERMAN (Miembro del equipo de trabajo)
- LOPEZ SOLANILLA, EMILIA ANTONIA (Miembro del equipo de trabajo)
- DE FRANCESCO, AGUSTINA (Miembro del equipo de trabajo)
- MEDINA ALCAZAR, JOAQUIN (Miembro del equipo de trabajo)
- FORTUNY CECCONI, AGUSTINA PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
- SANTAMARIA FERNANDEZ, MARIA ESTRELLA (Miembro del equipo de trabajo)
- TOME AMAT, JAIME MARIA (Miembro del equipo de trabajo)
- PERALES, MARIANO MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- RICO MOLINS, JUAN (Miembro del equipo de trabajo)
- TOMAZ SANTOS BOTELHO, JOAO FRANCISCO (Miembro del equipo de trabajo)
- PEREZ CANTALAPIEDRA, CARLOS (Miembro del equipo de trabajo)
- WILKINSON, MARK DENIS (Miembro del equipo de trabajo)
- Toribio Lopez, Francisco Rene (Miembro del equipo de trabajo)
- IGLESIAS FERNANDEZ, RAQUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- SANTAMARIA HERNANDO, SARAY (Miembro del equipo de trabajo)
- RUBIO HERRERO, LUIS MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- RAHO HOURCADES, NICOLAS (Miembro del equipo de trabajo)
- IMPERIAL RÓDENAS, JUAN (Miembro del equipo de trabajo)
Ejecución: 01-01-2022 - 31-12-2025
Tipo: Nacional
- iMarina
COLABORACIÓN EN LA IMPLEMENTACIÓN DE TECHNOLOGÍAS FAIR, INCLUSIVO UNA PLATAFORMA PILOTO DE FAIR EN EL CENTRO CBGP
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 02-01-2020 - 01-01-2021
Tipo: Interno
- iMarina
PERFORM TRAINING MODULES ON FAIR DATA STEWARDSHIP COUSES BY PHORTOS
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 25-05-2019 - 25-06-2019
Tipo: Interno
- iMarina
PERFORM TRAINING MODULES ON FAIR DATA STEWARDSHIP COURSES OFFERED BY PHORTOS
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 08-10-2019 - 08-11-2019
Tipo: Interno
- iMarina
European Joint Programme on Rare Diseases
- BENHAMED, OUSSAMA MOHAMMED (Participante)
- CAMARA BALLESTEROS, ALBERTO (Participante)
- ALARCON MORENO, PABLO (Participante)
- PRIETO GODOY, MARIO (Participante)
- WILKINSON, MARK DENIS (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-01-2019 - 31-08-2024
Tipo: Internacional
Importe financiado: 341571,13 Euros.
- iMarina
Applying deep semantics to the representation of clinical data to improve machine usability
- Wilkinson, Mark D. (Director) Doctorando: Alarcón Moreno, Pablo
24/9/2024
- iMarina
FAIR metadata, models, and interfaces to support machine-readable data access and use conditions
- Wilkinson, Mark D. (Director) Doctorando: Benhamed, Oussama Mohammed
8/7/2024
- iMarina
Detection and formal classification of certainty and its application to text mining of chains of scholarly statements
- Wilkinson, Mark D. (Director) Doctorando: Prieto Godoy, Mario
1/1/2019
- iMarina
Bioinformatic approaches to understand RNA biology in the rice blast fungus
- Wilkinson, Mark D. (Director)
- SESMA GALARRAGA, Ane (Director)
- WILKINSON, MARK DENIS (Director) Doctorando: Marconi, Marco
1/1/2017
- iMarina
FAIR approaches applied to unraveling Plant-Pathogen Interactions Data and RNA Processing Evolution
- Wilkinson, Mark D. (Director)
- SESMA GALARRAGA, Ane (Director)
- WILKINSON, MARK DENIS (Director) Doctorando: Rodríguez Iglesias, Alejandro
1/9/2016
- iMarina
FAIR Data Point
- Bonino da Silva Santos, Luiz Olavo (Autor o Coautor)
- Dennis, J. van Gerwen (Autor o Coautor)
- Burger, Kees (Autor o Coautor)
- Kaliyaperumal, Rajaram (Autor o Coautor)
- Suchánek, Marek (Autor o Coautor)
- Slifka, Jan (Autor o Coautor)
- Wilkinson, Mark (Autor o Coautor)
15/9/2025
- iMarina
Grupos de investigación
Perfiles de investigador/a
-
ORCID
-
Publons
-
Scopus Author ID