Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es
Actividades
- Artículos 75
- Libros 0
- Capítulos de libro 5
- Congresos 39
- Documentos de trabajo 0
- Informes técnicos 0
- Proyectos de investigación 16
- Tesis dirigidas 12
- Patentes o licencias de software 0
A New Improved and Extended Version of the Multicell Bacterial Simulator gro
- Gutierrez, Martin
- Gregorio-Godoy, Paula
- Perez del Pulgar, Guillermo
- Munoz, Luis E.
- Saez, Sandra
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Acs Synthetic Biology (p. 1496-1508) - 18/8/2017
10.1021/acssynbio.7b00003 Ver en origen
- ISSN 21615063
BioBlocks: Programming Protocols in Biology Made Easier
- Gupta, Vishal
- Irimia, Jesus
- Pau, Ivan
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Acs Synthetic Biology (p. 1230-1232) - 21/7/2017
10.1021/acssynbio.6b00304 Ver en origen
- ISSN 21615063
Bolaform Surfactant-Induced Au Nanoparticle Assemblies for Reliable Solution-Based Surface-Enhanced Raman Scattering Detection
- Garcia-Lojo, Daniel
- Mendez-Merino, David
- Perez-Juste, Ignacio
- Acuna, Angel
- Garcia-Rio, Luis
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Pastoriza-Santos, Isabel
- Perez-Juste, Jorge;
Advanced Materials Technologies - 1/1/2022
10.1002/admt.202101726 Ver en origen
- ISSN 2365709X
KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions
- Wang, Shudong
- Du, Zhenzhen
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao;
Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022
10.1007/s10489-021-02454-8 Ver en origen
- ISSN 0924669X
An Autonomous In Vivo Dual Selection Protocol for Boolean Genetic Circuits
- Benes, David
- Sosik, Petr
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Artificial Life (p. 247-260) - 26/5/2015
10.1162/artl_a_00160 Ver en origen
- ISSN 10645462
Multi-TransDTI: Transformer for Drug–Target Interaction Prediction Based on Simple Universal Dictionaries with Multi-View Strategy
Biomolecules - 1/1/2022
10.3390/biom12050644 Ver en origen
- ISSN 2218273X
CSConv2d: A 2-D Structural Convolution Neural Network with a Channel and Spatial Attention Mechanism for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction
- Wang, Xun
- Liu, Dayan
- Zhu, Jinfu
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao;
Biomolecules - 1/5/2021
10.3390/biom11050643 Ver en origen
- ISSN 2218273X
A P system and a constructive membrane-inspired DNA algorithm for solving the Maximum Clique Problem
- Garcia-Arnau, Marc
- Manrique, Daniel
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Sosik, Petr
Biosystems (p. 687-697) - 1/11/2007
10.1016/j.biosystems.2007.02.005 Ver en origen
- ISSN 03032647
DNA strand displacement system running logic programs
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Sainz de Murieta, Inaki
- Sosik, Petr;
Biosystems (p. 5-12) - 1/1/2014
10.1016/j.biosystems.2013.10.006 Ver en origen
- ISSN 03032647
Este/a investigador/a no tiene libros.
Biomolecular computing devices in synthetic biology
- Miró J
- Rodríguez-Patón A
Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008
Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques
- Manrique D
- Ríos J
- Rodríguez-Patón A
Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005
On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Petr Sosík
- Ludek Cienciala
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010
- iMarina
Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes
- Petr Sosík
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Lucie Ciencialová
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010
- iMarina
An implementation of elementary arithmetic with virus machine
- Xiaoshan Yan
- Xiangrong Liu
- Xiangxiang Zeng
- Alfonso Rodríquez Patón
Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018
10.1007/978-3-030-00265-7_24 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation
- García A
- Rodríguez-Patón A
A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015
10.1007/978-3-319-19776-0_1 Ver en origen
- ISSN 21945357
- iMarina
- iMarina
BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation
- Prestes Garcia, Antonio
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015
10.1007/978-3-319-18944-4_26 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
One-gene oscillators with a positive transcriptional feedback and a negative interaction
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Engeneious Conference 2012 (p. 31-31) - 25/6/2012
- iMarina
Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator
- Gutierrez, Martin
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Fourteenth European Conference On Artificial Life (Ecal 2017) (p. 186-187) - 1/1/2017
- iMarina
DNA assembly and recombination for Hamiltonian paths and binary words
- Pazos, A
- Pazos, J
- Paton, AR;
Gecco-99: Proceedings Of The Genetic And Evolutionary Computation Conference (p. 1822-1824) - 1/1/1999
- iMarina
Hopcroft’s Minimization Technique: Queues or Stacks?
- un
- Mihaela Pă
- PAUN, PAUL ANDREI
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Hopcroft’S Minimization Technique: Queues Or Stacks? (p. 78-91) - 21/7/2008
Biochemical Signaling: a discrete simulation with Memory Enhancement
- Paun A
- Paun M
- Rodriguez-Paton A
- Jack J
Ieee 1st International Conference On Computational Advances In Bio And Medical Sciences, Iccabs 2011, (p. 257-257) - 3/2/2011
10.1109/iccabs.2011.5729910 Ver en origen
- iMarina
- iMarina
Initialization method for grammar-guided genetic programming
- García-Arnau M
- Manrique D
- Ríos J
- Rodríguez-Patón A
Knowledge-Based Systems (p. 127-133) - 1/1/2007
10.1016/j.knosys.2006.11.006 Ver en origen
- ISSN 09507051
Distributed computing with prokaryotic immune systems
- Murphy N
- Rodríguez-Patón A
Lecture Notes In Computer Science (p. 286-288) - 24/9/2012
10.1007/978-3-642-33757-4_22 Ver en origen
- ISSN 03029743
Towards a robust biocomputing solution of intractable problems
- Marc García-Arnau
- Sosik, Petr
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
- MANRIQUE GAMO, DANIEL
Lecture Notes In Computer Science (p. 221-230) - 27/8/2008
10.1007/978-3-540-77962-9_23 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.
Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.
Ultrasensitive BIOsensing platform for multiplex CELLular protein PHEnotyping at single-cell level
- LEON PRIETO, LUCIA (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-04-2021 - 31-03-2025
Tipo: Internacional
Importe financiado: 303250,00 Euros.
- iMarina
Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Participante)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Mitrana, Victor (Participante)
Ejecución: 01-06-2020 - 31-05-2023
Tipo: Nacional
Importe financiado: 87120,00 Euros.
- iMarina
Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Ejecución: 30-12-2016 - 29-12-2020
Tipo: Nacional
Importe financiado: 90387,00 Euros.
- iMarina
General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
- Gupta, Vishal (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Ejecución: 01-10-2013 - 30-09-2016
Tipo: Internacional
Importe financiado: 381795,00 Euros.
- iMarina
Engineering multicellular biocircuits: programming cell-cell communication using plasmids as wires
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Maojo García, Víctor Manuel (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- GREGORIO GODOY, PAULA (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- Molina González, Martín (Participante)
Ejecución: 01-10-2013 - 30-09-2016
Tipo: Internacional
Importe financiado: 570600,00 Euros.
- iMarina
Programación e ingeniería de biocircuitos: diseño y modelado in silico
- GREGORIO GODOY, PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
- ZENG, XIANGXIANG (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-01-2013 - 31-03-2017
Tipo: Nacional
Importe financiado: 156312,00 Euros.
- iMarina
Modelado de procesos biológicos con sistemas P y diseño de nuevos dispositivos de cómputo biomoleculares
- MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-01-2010 - 31-07-2013
Tipo: Nacional
Importe financiado: 111078,01 Euros.
- iMarina
Placing the T3SS effector-network paradigm within a systems level understanding of in vivo infection
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 02-05-2022 - 01-05-2027
Tipo: Internacional
- iMarina
APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL
- GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 06-04-2022 - 24-07-2022
Tipo: Interno
- iMarina
Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos
1/1/2021
- iMarina
Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
- PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula
1/1/2018
- iMarina
Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein
1/1/2017
- iMarina
An end-to-end solution for automation of biological protocols
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal
1/1/2017
- iMarina
Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio
1/1/2017
- iMarina
A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo
1/1/2017
- iMarina
Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David
1/1/2016
- iMarina
Inference Models in DNA Computing
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes
1/1/2013
- iMarina
Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno
1/1/2012
- iMarina
Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.
Grupos de investigación
-
Grupo de Inteligencia Artificial (LIA)
Rol: Investigador Principal
Perfiles de investigador/a
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