Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es
Publications
- Articles 75
- Books 0
- Book chapters 5
- Conferences 39
- Working papers 0
- Technical reports 0
- Research projects 16
- Supervised theses 12
- Patent or software license 0
An Autonomous In Vivo Dual Selection Protocol for Boolean Genetic Circuits
- Benes, David
- Sosik, Petr
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Artificial Life (p. 247-260) - 26/5/2015
10.1162/artl_a_00160 View at source
- ISSN 10645462
KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions
- Wang, Shudong
- Du, Zhenzhen
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao;
Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022
10.1007/s10489-021-02454-8 View at source
- ISSN 0924669X
Bolaform Surfactant-Induced Au Nanoparticle Assemblies for Reliable Solution-Based Surface-Enhanced Raman Scattering Detection
- Garcia-Lojo, Daniel
- Mendez-Merino, David
- Perez-Juste, Ignacio
- Acuna, Angel
- Garcia-Rio, Luis
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Pastoriza-Santos, Isabel
- Perez-Juste, Jorge;
Advanced Materials Technologies - 1/1/2022
10.1002/admt.202101726 View at source
- ISSN 2365709X
A New Improved and Extended Version of the Multicell Bacterial Simulator gro
- Gutierrez, Martin
- Gregorio-Godoy, Paula
- Perez del Pulgar, Guillermo
- Munoz, Luis E.
- Saez, Sandra
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Acs Synthetic Biology (p. 1496-1508) - 18/8/2017
10.1021/acssynbio.7b00003 View at source
- ISSN 21615063
BioBlocks: Programming Protocols in Biology Made Easier
- Gupta, Vishal
- Irimia, Jesus
- Pau, Ivan
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Acs Synthetic Biology (p. 1230-1232) - 21/7/2017
10.1021/acssynbio.6b00304 View at source
- ISSN 21615063
This researcher has no books.
An implementation of elementary arithmetic with virus machine
- Xiaoshan Yan
- Xiangrong Liu
- Xiangxiang Zeng
- Alfonso Rodríquez Patón
Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018
10.1007/978-3-030-00265-7_24 View at source
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Petr Sosík
- Ludek Cienciala
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010
- iMarina
Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes
- Petr Sosík
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Lucie Ciencialová
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010
- iMarina
Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques
- Manrique D
- Ríos J
- Rodríguez-Patón A
Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005
Biomolecular computing devices in synthetic biology
- Miró J
- Rodríguez-Patón A
Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008
Normal forms for spiking neural P systems
- Óscar H Ibarra
- Andrei Paun
- Gheorge Paun
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Petr Sosík
- Sara Woodworth
Theoretical Computer Science (p. 196-217) - 15/3/2007
10.1016/j.tcs.2006.11.025 View at source
- ISSN 03043975
- iMarina
- iMarina
Tissue P systems
- Martín-Vide C
- Pǎun G
- Pazos J
- Rodríguez-Patón A
Theoretical Computer Science (p. 295-326) - 8/3/2003
10.1016/s0304-3975(02)00659-x View at source
- ISSN 03043975
Computing with membranes: P systems with Worm-Objects
- Castellanos, J
- Paun, G
- Rodriguez-Paton, A;
Spire 2000: Seventh International Symposium On String Processing And Information Retrieval - Proceedings (p. 65-74) - 1/1/2000
CONTEXT MEASURE IN QUALITATIVE REASONING
- GOMEZPEREZ, A
- JURISTO, N
- PAZOS, J
- PATON, AR;
Qualitative Reasoning And Decision Technologies (p. 605-612) - 1/1/1993
- iMarina
Spiking Neural P Systems with Several Types of Spikes
- Mihai Ionescu
- Gheorge Paun
- Mario de Jesús Pérez Jiménez
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
Proceedings Of The Ninth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 183-192) - 31/1/2011
10.15837/ijccc.2011.4.2092 View at source
- ISSN 18419836
- iMarina
- iMarina
Designing radial basis function networks with genetic algorithms
- Camacho, F
- Manrique, D
- Rodriguez-Paton, A;
Proceedings Of The Eighth Iasted International Conference On Artificial Intelligence And Soft Computing (p. 398-403) - 1/1/2004
- iMarina
Self-consciousness for artificial entities using Modular Neural Networks
- Martinez Luaces, Milton
- Gayoso Rocha, Celina
- Pazos Sierra, Juan
- Rodriguez Paton, Alfonso;
Proceedings Of The 9th Wseas International Conference On Neural Networks (Nn' 08) (p. 113-118) - 1/1/2008
- iMarina
BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences
- Jesus Irimia
- Gupta, Vishal
- PAU DE LA CRUZ, IVAN
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016
- iMarina
LncRNA-disease association prediction based on neighborhood information aggregation in neural network
- Chen H
- Wang X
- Zhang X
- Zeng X
- Song T
- Rodriguez-Paton A
Proceedings - 2018 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2018 (p. 175-178) - 21/1/2019
10.1109/bibm.2018.8621441 View at source
- ISSN 21561133
- iMarina
- iMarina
Iteratively collective prediction of disease-gene associations through the incomplete network
- Meng, Xiangyi
- Zou, Quan
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Zeng, Xiangxiang;
Proceedings - 2017 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2017 (p. 1324-1330) - 15/12/2017
10.1109/bibm.2017.8217854 View at source
- iMarina
- iMarina
This researcher has no working papers.
This researcher has no technical reports.
Ultrasensitive BIOsensing platform for multiplex CELLular protein PHEnotyping at single-cell level
- LEON PRIETO, LUCIA (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 01-04-2021 - 31-03-2025
Type of funding: International
Amount of funding: 303250,00 Euros.
- iMarina
Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Participante)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Mitrana, Victor (Participante)
Period: 01-06-2020 - 31-05-2023
Type of funding: National
Amount of funding: 87120,00 Euros.
- iMarina
Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Period: 30-12-2016 - 29-12-2020
Type of funding: National
Amount of funding: 90387,00 Euros.
- iMarina
General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
- Gupta, Vishal (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Period: 01-10-2013 - 30-09-2016
Type of funding: International
Amount of funding: 381795,00 Euros.
- iMarina
Engineering multicellular biocircuits: programming cell-cell communication using plasmids as wires
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Maojo García, Víctor Manuel (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- GREGORIO GODOY, PAULA (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- Molina González, Martín (Participante)
Period: 01-10-2013 - 30-09-2016
Type of funding: International
Amount of funding: 570600,00 Euros.
- iMarina
Programación e ingeniería de biocircuitos: diseño y modelado in silico
- GREGORIO GODOY, PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
- ZENG, XIANGXIANG (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 01-01-2013 - 31-03-2017
Type of funding: National
Amount of funding: 156312,00 Euros.
- iMarina
Modelado de procesos biológicos con sistemas P y diseño de nuevos dispositivos de cómputo biomoleculares
- MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 01-01-2010 - 31-07-2013
Type of funding: National
Amount of funding: 111078,01 Euros.
- iMarina
Placing the T3SS effector-network paradigm within a systems level understanding of in vivo infection
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 02-05-2022 - 01-05-2027
Type of funding: International
- iMarina
APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL
- GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 06-04-2022 - 24-07-2022
Type of funding: Internal
- iMarina
Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos
1/1/2021
- iMarina
Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
- PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula
1/1/2018
- iMarina
Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein
1/1/2017
- iMarina
An end-to-end solution for automation of biological protocols
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal
1/1/2017
- iMarina
Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio
1/1/2017
- iMarina
A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo
1/1/2017
- iMarina
Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David
1/1/2016
- iMarina
Inference Models in DNA Computing
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes
1/1/2013
- iMarina
Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno
1/1/2012
- iMarina
This researcher has no patents or software licenses.
Research groups
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Grupo de Inteligencia Artificial (LIA)
Role: Investigador Principal
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