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Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es

INTELIGENCIA ARTIFICIAL / Universidad Politécnica de Madrid

Publications

Probability-based collaborative filtering model for predicting gene-disease associations

  • Zeng, Xiangxiang
  • Ding, Ningxiang
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Zou, Quan;

Bmc Medical Genomics - 28/12/2017

10.1186/s12920-017-0313-y View at source

  • ISSN 17558794

Sensitivity analysis of Repast computational ecology models with R/Repast

  • Prestes Garcia, Antonio
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Ecology And Evolution (p. 8811-8831) - 1/12/2016

10.1002/ece3.2580 View at source

  • ISSN 20457758

Sequential SNP systems based on min/max spike number

  • Ibarra, Oscar H.
  • Paun, Andrei
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Theoretical Computer Science (p. 2982-2991) - 20/8/2009

10.1016/j.tcs.2009.03.004 View at source

  • ISSN 03043975

Special Issue: DNA Computing and Molecular Programming 2017-Selected papers from 2017 Conference/Special Issue: A Natural Computing Approach to Synthetic and Systems Biology Preface

  • Cavaliere, Matteo
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Natural Computing (p. 759-759) - 1/12/2018

10.1007/s11047-018-9719-5 View at source

  • ISSN 15677818

Spiking Neural P Systems With Colored Spikes

  • Song, Tao
  • Rodriguez-Paion, Alfonso
  • Zheng, Pan
  • Zeng, Xiangxiang;

Ieee Transactions On Cognitive And Developmental Systems (p. 1106-1115) - 1/12/2018

10.1109/tcds.2017.2785332 View at source

  • ISSN 23798920

Spiking Neural P Systems With Learning Functions

  • Song, Tao
  • Pan, Linqiang
  • Wu, Tingfang
  • Zheng, Pan
  • Wong, M. L. Dennis
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Ieee Transactions On Nanobioscience (p. 176-190) - 1/4/2019

10.1109/tnb.2019.2896981 View at source

  • ISSN 15361241

Spiking Neural P Systems: Stronger Normal Forms

  • Marc García Arnau
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík

International Journal Of Unconventional Computing (p. 411-425) - 1/12/2009

  • ISSN 15487199
  • iMarina

Structural Hole Spanner in HumanNet Identifies Disease Gene and Drug targets

  • Zeng, Xiangxiang
  • Lin, Jiawei
  • Lin, Chen
  • Liu, Xiangrong
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Ieee Access (p. 35392-35401) - 26/6/2018

10.1109/access.2018.2849216 View at source

  • ISSN 21693536

Symport/antiport P systems with three objects are universal

  • Paun, G
  • Perez-Jimenez, MJ
  • Pazos, J
  • Rodriguez-Paton, A;

Fundamenta Informaticae (p. 353-367) - 1/1/2005

  • ISSN 01692968
  • iMarina

THE SOCIAL SIDE AND TIME DIMENSION OF SELF-REPRESENTATION IN AGENTS USING MODULAR NEURAL NETWORKS

  • Luaces, Milton M.
  • Pazos, Juan
  • Rocha, Celina G.
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Neural Network World (p. 437-458) - 1/12/2008

  • ISSN 12100552
  • iMarina

This researcher has no books.

An implementation of elementary arithmetic with virus machine

  • Xiaoshan Yan
  • Xiangrong Liu
  • Xiangxiang Zeng
  • Alfonso Rodríquez Patón

Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018

10.1007/978-3-030-00265-7_24 View at source

  • ISSN 03029743

Biomolecular computing devices in synthetic biology

  • Miró J
  • Rodríguez-Patón A

Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008

10.4018/978-1-59904-996-0.ch014 View at source

On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík
  • Ludek Cienciala

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010

  • iMarina

Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques

  • Manrique D
  • Ríos J
  • Rodríguez-Patón A

Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005

10.4018/978-1-59140-902-1.ch005 View at source

Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes

  • Petr Sosík
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Lucie Ciencialová

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010

  • iMarina

A Parallel DNA Algorithm Using a Microfluidic Device to Build Scheduling Grids

  • García-Arnau M
  • Manrique D
  • Rodríguez-Patón A

Lecture Notes In Computer Science (p. 193-202) - 18/6/2007

  • ISSN 03029743
  • iMarina

A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation

  • García A
  • Rodríguez-Patón A

A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015

10.1007/978-3-319-19776-0_1 View at source

  • ISSN 21945357

A new class of symbolic abstract neural nets: Tissue P systems

  • MartÍn-Vide C
  • Pazos J
  • Păun G
  • RodrÍguez-PatÓn A

Lecture Notes In Computer Science (p. 290-299) - 1/1/2002

  • ISSN 03029743
  • iMarina

A new model of synthetic genetic oscillator based on trans-acting repressor ribozyme

  • Bueno J
  • Rodríguez-Patón A

Lecture Notes In Computer Science (p. 1170-1177) - 1/1/2009

10.1007/978-3-642-02481-8_177 View at source

  • ISSN 03029743

An auxin hormone - signaling factors oscillator regulates time-dependent branching in the Arabidopsis root

  • Marcos Rodriguez
  • Juan Perianez-Rodriguez
  • Juan Carlos del Pozo
  • Angela Saez
  • SANCHEZ CORRIONERO, ALVARO
  • BUSTILLO AVENDAÑO, ESTEFANO
  • MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
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Libro De Resumenes Del Xv Simposio De Fitohormonas De La Sociedad Española De Fisiología Vegetal (p. 28-28) - 13/12/2018

  • iMarina

Autonomous resolution based on DNA strand displacement

  • Sosik, Petr
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Lecture Notes In Computer Science (p. 190-203) - 29/9/2011

10.1007/978-3-642-23638-9_16 View at source

  • ISSN 03029743

BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation

  • Prestes Garcia, Antonio
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015

10.1007/978-3-319-18944-4_26 View at source

  • ISSN 03029743

BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences

  • Jesus Irimia
  • Gupta, Vishal
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016

  • iMarina

Biochemical Signaling: a discrete simulation with Memory Enhancement

  • Paun A
  • Paun M
  • Rodriguez-Paton A
  • Jack J

Ieee 1st International Conference On Computational Advances In Bio And Medical Sciences, Iccabs 2011, (p. 257-257) - 3/2/2011

10.1109/iccabs.2011.5729910 View at source

CONTEXT MEASURE IN QUALITATIVE REASONING

  • GOMEZPEREZ, A
  • JURISTO, N
  • PAZOS, J
  • PATON, AR;

Qualitative Reasoning And Decision Technologies (p. 605-612) - 1/1/1993

  • iMarina

This researcher has no working papers.

This researcher has no technical reports.

APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL

  • GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 06-04-2022 - 24-07-2022

Type of funding: Internal

  • iMarina

BACTOCOM: Bacterial Computing with Engineered Populations.

  • MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • Sosik, Petr (Participante)
  • GOMEZ ESTEBAN, PABLO (Participante)

Period: 01-02-2010 - 31-07-2013

Type of funding: International

Amount of funding: 240918,00 Euros.

  • iMarina

Desarrollo de aplicaciones de la computación celular con membranas y la computación biomolecular en la biología

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 01-10-2006 - 31-12-2009

Type of funding: National

  • iMarina

Descifrando las infecciones bacterianas con técnicas de inteligencia artificial e ingeniería de biocircuitos

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • Mitrana, Victor (Participante)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • LEON PRIETO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
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Period: 01-09-2023 - 31-08-2026

Type of funding: National

  • iMarina

EVOlutionary PROgrammable antiBIOTICS

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 01-03-2014 - 28-02-2017

Type of funding: National

Amount of funding: 20862,00 Euros.

  • iMarina

Engineering multicellular biocircuits: programming cell-cell communication using plasmids as wires

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • Maojo García, Víctor Manuel (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
  • Sosik, Petr (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • GREGORIO GODOY, PAULA (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • Molina González, Martín (Participante)
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Period: 01-10-2013 - 30-09-2016

Type of funding: International

Amount of funding: 570600,00 Euros.

  • iMarina

General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
  • Gupta, Vishal (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
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Period: 01-10-2013 - 30-09-2016

Type of funding: International

Amount of funding: 381795,00 Euros.

  • iMarina

Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • Mitrana, Victor (Participante)
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Period: 01-06-2020 - 31-05-2023

Type of funding: National

Amount of funding: 87120,00 Euros.

  • iMarina

Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
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Period: 30-12-2016 - 29-12-2020

Type of funding: National

Amount of funding: 90387,00 Euros.

  • iMarina

LIA. Ingeniería microbiana, salud y calidad de vida.

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • SONG, TAO (Participante)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Participante)
  • ZENG, XIANGXIANG (Participante)

Period: 01-01-2018 - 30-06-2022

Type of funding: Regional

Amount of funding: 29881,60 Euros.

  • iMarina

A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo

1/1/2017

  • iMarina

An end-to-end solution for automation of biological protocols

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal

1/1/2017

  • iMarina

Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David

1/1/2016

  • iMarina

Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein

1/1/2017

  • iMarina

Inference Models in DNA Computing

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes

1/1/2013

  • iMarina

La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: MARTINEZ LUACES, Milton

1/1/2009

  • iMarina

Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos

1/1/2021

  • iMarina

Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio

1/1/2017

  • iMarina

Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
  • PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula

1/1/2018

  • iMarina

Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno

1/1/2012

  • iMarina

This researcher has no patents or software licenses.

Last data update: 3/19/24 12:53 AM