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Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es

INTELIGENCIA ARTIFICIAL / Universidad Politécnica de Madrid

Publications

Multi-TransDTI: Transformer for Drug–Target Interaction Prediction Based on Simple Universal Dictionaries with Multi-View Strategy

  • Wang G
  • Zhang X
  • Pan Z
  • Patón AR
  • Wang S
  • Song T
  • Gu Y
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Biomolecules - 1/1/2022

10.3390/biom12050644 View at source

  • ISSN 2218273X

Monodirectional tissue P systems with channel states

  • Song B
  • Zeng X
  • Rodríguez-Patón A

Information Sciences (p. 206-219) - 1/1/2021

10.1016/j.ins.2020.08.030 View at source

  • ISSN 00200255

Molormer: a lightweight self-attention-based method focused on spatial structure of molecular graph for drug-drug interactions prediction

  • Zhang X
  • Wang G
  • Meng X
  • Wang S
  • Zhang Y
  • Rodriguez-Paton A
  • Wang J
  • Wang X
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Briefings In Bioinformatics - 19/7/2022

10.1093/bib/bbac296 View at source

  • ISSN 14675463

Meta-Path Methods for Prioritizing Candidate Disease miRNAs

  • Zhang, Xuan
  • Zou, Quan
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Zeng, Xiangxiang;

Ieee-Acm Transactions On Computational Biology And Bioinformatics (p. 283-291) - 1/1/2019

10.1109/tcbb.2017.2776280 View at source

  • ISSN 15455963

Membrane computing and complexity theory: A characterization of PSPACE

  • Sosik, Petr
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Journal Of Computer And System Sciences (p. 137-152) - 1/1/2007

10.1016/j.jcss.2006.10.001 View at source

  • ISSN 00220000

KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions

  • Wang, Shudong
  • Du, Zhenzhen
  • Ding, Mao
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Song, Tao;

Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022

10.1007/s10489-021-02454-8 View at source

  • ISSN 0924669X

Highly Biocompatible Drug-Delivery Systems Based on DNA Nanotechnology

  • Li, Xin
  • Hong, Li
  • Song, Tao
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Chen, Congzhou
  • Zhao, Haiyan
  • Shi, Xiaolong;
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Journal Of Biomedical Nanotechnology (p. 747-757) - 1/7/2017

10.1166/jbn.2017.2383 View at source

  • ISSN 15507033

Grammar based crossover operator in genetic programming

  • Manrique, D
  • Marquez, F
  • Rios, J
  • Rodriguez-Paton, A;

Lecture Notes In Computer Science (p. 252-261) - 1/1/2005

10.1007/11499305_26 View at source

  • ISSN 03029743

Evolutionary system for automatically constructing and adapting radial basis function networks

  • Manrique, Daniel
  • Rios, Juan
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Neurocomputing (p. 2268-2283) - 1/1/2006

10.1016/j.neucom.2005.06.018 View at source

  • ISSN 09252312

Engineered toxin–intein antimicrobials can selectively target and kill antibiotic-resistant bacteria in mixed populations

  • López-Igual R
  • Bernal-Bayard J
  • Rodríguez-Patón A
  • Ghigo J
  • Mazel D

Nature Biotechnology (p. 755-+) - 1/7/2019

10.1038/s41587-019-0105-3 View at source

  • ISSN 10870156

This researcher has no books.

Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes

  • Petr Sosík
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Lucie Ciencialová

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010

  • iMarina

Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques

  • Manrique D
  • Ríos J
  • Rodríguez-Patón A

Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005

10.4018/978-1-59140-902-1.ch005 View at source

On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík
  • Ludek Cienciala

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010

  • iMarina

Biomolecular computing devices in synthetic biology

  • Miró J
  • Rodríguez-Patón A

Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008

10.4018/978-1-59904-996-0.ch014 View at source

An implementation of elementary arithmetic with virus machine

  • Xiaoshan Yan
  • Xiangrong Liu
  • Xiangxiang Zeng
  • Alfonso Rodríquez Patón

Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018

10.1007/978-3-030-00265-7_24 View at source

  • ISSN 03029743

Towards a robust biocomputing solution of intractable problems

  • Marc García-Arnau
  • Sosik, Petr
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL

Lecture Notes In Computer Science (p. 221-230) - 27/8/2008

10.1007/978-3-540-77962-9_23 View at source

  • ISSN 03029743

Tissue P systems

  • Martín-Vide C
  • Pǎun G
  • Pazos J
  • Rodríguez-Patón A

Theoretical Computer Science (p. 295-326) - 8/3/2003

10.1016/s0304-3975(02)00659-x View at source

  • ISSN 03043975

Spiking Neural P Systems with Several Types of Spikes

  • Mihai Ionescu
  • Gheorge Paun
  • Mario de Jesús Pérez Jiménez
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas

Proceedings Of The Ninth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 183-192) - 31/1/2011

10.15837/ijccc.2011.4.2092 View at source

  • ISSN 18419836

Solving SAT in linear time with a neural-like membrane system

  • Pazos J
  • Rodríguez-Patón A
  • Silva A

Lecture Notes In Computer Science (p. 662-669) - 1/1/2003

  • ISSN 03029743
  • iMarina

Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator

  • Gutierrez, Martin
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Fourteenth European Conference On Artificial Life (Ecal 2017) (p. 186-187) - 1/1/2017

  • iMarina

Simulating a Rock-Scissors-Paper Bacterial Game with a Discrete Cellular Automaton

  • Gómez Esteban P
  • Rodríguez-Patón A

Lncs (p. 363-370) - 30/5/2011

10.1007/978-3-642-21326-7_39 View at source

  • ISSN 03029743

Sequentiality induced by spike number in SNP systems

  • Ibarra O
  • Pǎun A
  • Rodríguez-Patón A

Lecture Notes In Computer Science (p. 179-190) - 27/11/2009

10.1007/978-3-642-03076-5_15 View at source

  • ISSN 03029743

Self-consciousness for artificial entities using Modular Neural Networks

  • Martinez Luaces, Milton
  • Gayoso Rocha, Celina
  • Pazos Sierra, Juan
  • Rodriguez Paton, Alfonso;

Proceedings Of The 9th Wseas International Conference On Neural Networks (Nn' 08) (p. 113-118) - 1/1/2008

  • iMarina

Probabilistic reasoning with an enzyme-driven DNA device

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Lecture Notes In Computer Science (p. 160-173) - 2/12/2013

10.1007/978-3-319-01928-4_12 View at source

  • ISSN 03029743

Polynomial complexity classes in spiking neural P systems

  • Sosík P
  • Rodríguez-Patón A
  • Ciencialová L

Lecture Notes In Computer Science (p. 348-360) - 1/12/2010

10.1007/978-3-642-18123-8-27 View at source

  • ISSN 03029743

This researcher has no working papers.

This researcher has no technical reports.

Ultrasensitive BIOsensing platform for multiplex CELLular protein PHEnotyping at single-cell level

  • LEON PRIETO, LUCIA (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
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Period: 01-04-2021 - 31-03-2025

Type of funding: International

Amount of funding: 303250,00 Euros.

  • iMarina

Programación e ingeniería de biocircuitos: diseño y modelado in silico

  • GREGORIO GODOY, PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
  • ZENG, XIANGXIANG (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • Sosik, Petr (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
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Period: 01-01-2013 - 31-03-2017

Type of funding: National

Amount of funding: 156312,00 Euros.

  • iMarina

Placing the T3SS effector-network paradigm within a systems level understanding of in vivo infection

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 02-05-2022 - 01-05-2027

Type of funding: International

  • iMarina

PROgramable living drugs engineering MIcrobial CELLS

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 01-06-2019 - 31-05-2021

Type of funding: National

Amount of funding: 24700,00 Euros.

  • iMarina

PROGRAMMABLE BIOLOGICAL MACHINES

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 01-09-2017 - 31-12-2020

Type of funding: National

Amount of funding: 24642,00 Euros.

  • iMarina

Modelado de procesos biológicos con sistemas P y diseño de nuevos dispositivos de cómputo biomoleculares

  • MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • Sosik, Petr (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Period: 01-01-2010 - 31-07-2013

Type of funding: National

Amount of funding: 111078,01 Euros.

  • iMarina

LIA. Ingeniería microbiana, salud y calidad de vida.

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • SONG, TAO (Participante)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Participante)
  • ZENG, XIANGXIANG (Participante)

Period: 01-01-2018 - 30-06-2022

Type of funding: Regional

Amount of funding: 29881,60 Euros.

  • iMarina

Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
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Period: 30-12-2016 - 29-12-2020

Type of funding: National

Amount of funding: 90387,00 Euros.

  • iMarina

Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • Mitrana, Victor (Participante)
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Period: 01-06-2020 - 31-05-2023

Type of funding: National

Amount of funding: 87120,00 Euros.

  • iMarina

General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
  • Gupta, Vishal (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
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Period: 01-10-2013 - 30-09-2016

Type of funding: International

Amount of funding: 381795,00 Euros.

  • iMarina

Una teoría para el desarrollo software construida mediante técnicas y modelos de gestión del conocimiento

  • Juan Manuel Ares Casal (Director)
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: María Aurora Martínez Rey

1/1/2008

  • iMarina

Una metodología para la gestión de conocimientos

  • Juan Pazos Sierra (Director)
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Luis Felipe Paradela González

1/1/2003

  • iMarina

Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno

1/1/2012

  • iMarina

Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
  • PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula

1/1/2018

  • iMarina

Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio

1/1/2017

  • iMarina

Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos

1/1/2021

  • iMarina

La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: MARTINEZ LUACES, Milton

1/1/2009

  • iMarina

Inference Models in DNA Computing

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes

1/1/2013

  • iMarina

Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein

1/1/2017

  • iMarina

Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David

1/1/2016

  • iMarina

This researcher has no patents or software licenses.

Last data update: 3/19/24 12:53 AM