Diaz Uriarte, Ramon r.diaz@uam.es

From genotypes to organisms: State-of-the-art and perspectives of a cornerstone in evolutionary dynamics

  • Manrubia, Susanna
  • Cuesta, Jose A.
  • Aguirre, Jacobo
  • Ahnert, Sebastian E.
  • Altenberg, Lee
  • V. Cano, Alejandro
  • Catalan, Pablo
  • Diaz-Uriarte, Ramon
  • Elena, Santiago F.
  • Garcia-Martin, Juan Antonio
  • Hogeweg, Paulien
  • Khatri, Bhavin S.
  • Krug, Joachim
  • Louis, Ard A.
  • Martin, Nora S.
  • Payne, Joshua L.
  • Tarnowski, Matthew J.
  • Weiss, Marcel;
... Ver más Contraer

Physics Of Life Reviews (p. 55-106) - 1/9/2021

10.1016/j.plrev.2021.03.004 Ver en origen

  • ISSN 15710645

Conditional prediction of consecutive tumor evolution using cancer progression models: What genotype comes next?

  • Diaz-Colunga, Juan
  • Diaz-Uriarte, Ramon;

Plos Computational Biology - 1/12/2021

10.1371/journal.pcbi.1009055 Ver en origen

  • ISSN 1553734X

Every which way? On predicting tumor evolution using cancer progression models

  • Diaz-Uriarte R
  • Vasallo C

Plos Computational Biology (p. 371039-371039) - 1/1/2019

10.1371/journal.pcbi.1007246 Ver en origen

  • ISSN 1553734X

Cancer progression models and fitness landscapes: A many-to-many relationship

  • Diaz-Uriarte R

Bioinformatics (p. 836-844) - 1/3/2018

10.1093/bioinformatics/btx663 Ver en origen

  • ISSN 13674803

Package ‘PHYLOGR’

  • Ramon Diaz-Uriarte
  • Theodore Garland Jr
  • Maintainer Ramon Diaz-Uriarte

Matrix - 1/1/2018

  • ISSN 09348832
  • iMarina

OncoSimulR: Genetic simulation with arbitrary epistasis and mutator genes in asexual populations

  • Diaz-Uriarte R

Bioinformatics (p. 1898-1899) - 15/6/2017

10.1093/bioinformatics/btx077 Ver en origen

  • ISSN 13674803

OncoSimulR: genetic simulation of cancer progression with arbitrary epistasis and mutator genes

  • Ramon Diaz-Uriarte

Biorxiv (p. 069500-069500) - 1/1/2016

  • iMarina

Genome wide association study identifies a novel putative mammographic density locus at 1q12-q21

  • Fernandez-Navarro P., González-Neira A., Pita G., Díaz-Uriarte R., Tais Moreno L., Ederra M., Pedraz-Pingarrõn C., Sánchez-Contador C., Vázquez-Carrete J., Moreo P., Vidal C., Salas-Trejo D., Stone J., Southey M., Hopper J., Pérez-Gõmez B., Benitez J., Pollan M.

International Journal Of Cancer (p. 2427-2427) - 1/1/2015

10.1002/ijc.29299 Ver en origen

  • ISSN 00207136

Identifying restrictions in the order of accumulation of mutations during tumor progression: effects of passengers, evolutionary models, and sampling

  • Diaz-Uriarte R

Bmc Bioinformatics (p. 41-41) - 1/1/2015

10.1186/s12859-015-0466-7 Ver en origen

  • ISSN 14712105

Inferring restrictions in the temporal order of mutations during tumor progression: effects of passengers, evolutionary models, and sampling

  • Diaz Uriarte, Ramon

Biorxiv (p. 005587-005587) - 1/1/2014

  • iMarina

A flexible statistical method for detecting genomic copy-number changes using Hidden Markov Models with reversible jump MCMC

  • Oscar M Rueda, Ramon Diaz-Uriarte

1/1/2006

  • iMarina

Effects of aggressive interactions on antipredator behavior: Empirical and theoretical aspects.

  • Ramón Diaz-Uriarte

1/1/2001

  • iMarina

Las aves urbanas

  • Díaz Uriarte, Ramón
  • Diez, Iñaki

1/1/1990

  • ISBN 84-86411-03-3
  • iMarina

Simulating evolution in asexual populations with epistasis

  • Ramon Diaz-Uriarte

Epistasis: Methods And Protocols. Methods In Molecular Biology (p. 121-154) - 23/5/2021

10.1007/978-1-0716-0947-7_9 Ver en origen

  • ISBN ISBN 978-1-0716-0946-0
  • ISSN 10643745

Supervised Methods with Genomic Data: A Review and Cautionary View

  • Diaz-Uriarte, Ramon

9780470094396 (p. 193-214) - 15/6/2005

10.1002/0470094419.ch12 Ver en origen

An applied statistician in microarray world: reviews and reflections

  • Díaz Uriarte, Ramón

X Conferencia Española De Biometría: (Libro De Resúmenes) (p. 9-9) - 1/1/2005

  • iMarina

The Use of Go Terms to Understand the Biological Significance of Microarray Differential Gene Expression

  • Diaz Uriarte, Ramon

Methods Of Microarray Data Analysis Iii (p. 233-247) - 1/1/2004

10.1007/0-306-48354-8_16 i Ver en origen

Reconstructing Ancestral Trait Values Using Squared-Change Parsimony: Plasma Osmolarity at the Origin of Amniotes,

  • Diaz Uriarte, Ramon

Amniote Origins : Completing The Transition To Land (p. 425-501) - 1/1/1997

10.1016/b978-012676460-4/50014-7 Ver en origen

Estimating the predictability of cancer evolution

  • Hosseini S
  • DIaz-Uriarte R
  • Markowetz F
  • Beerenwinkel N

Bioinformatics (p. i389-i397) - 15/7/2019

10.1093/bioinformatics/btz332 Ver en origen

  • ISSN 13674803

Genomic copy number alterations in cancer: high-resolution analysis of the NCI-60 panel

  • Rico, D.
  • Earl, J.
  • Diaz-Uriarte, R.
  • Rueda, O. M.
  • Marenne, G.
  • Pita, G.;

New Biotechnology (p. S81-S81) - 1/1/2010

10.1016/j.nbt.2010.01.228 Ver en origen

  • ISSN 18716784

Using gene ontology on genome-scale studies to find significant associations of biologically relevant terms to groups of genes 2003

  • Diaz Uriarte, Ramon

2003 Ieee Xiii Workshop On Neural Networks For Signal Processing - Nnsp'03 (p. 43-52) - 17/9/2003

10.1109/nnsp.2003.1318003 Ver en origen

Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.

Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.

Terapia antitumoral adaptativa usando datos transversales y predicciones de modelos de progresión tumoral

  • Diaz Uriarte, Ramon

Ejecución: 01-06-2020 - 31-05-2024

Tipo: Nacional

Importe financiado: 71874,00 Euros.

  • iMarina

IDENTIFICACION DE RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES DURANTE LA PROGRESION TUMORAL: METODOS DE INFERENCIA Y SOFTWARE DE SIMULACION

  • Diaz Uriarte, Ramon (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-01-2016 - 31-12-2020

Tipo: Internacional

Importe financiado: 49610,00 Euros.

  • iMarina

Implementación de modelos computacionales masivamente paralelos.

  • Gonzalez Martinez, Ivan (Investigador principal (IP))
  • Gustavo Daniel Sutter Capristo (Investigador/a)
  • Corcoles Ortega, Juan (Investigador/a)
  • Lopez de Vergara Mendez, Jorge Enrique (Investigador/a)
  • Pou Bell, Pablo (Investigador/a)
  • Perez Perez, Ruben (Investigador/a)
  • Pedro Sanchez, Luis DE (Investigador/a)
  • Masa Campos, Jose Luis (Investigador/a)
  • Gomez Arribas, Fco Javier (Investigador/a)
  • Tejero Gonzalez, Carlos Maria (Investigador/a)
  • Ruiz Cruz, Jorge Alfonso (Investigador/a)
  • Cabanas Sanchez, Veronica (Investigador/a)
  • Diaz Uriarte, Ramon (Investigador/a)
  • Rodrigo Insausti, Lucia (Investigador/a)
  • Peso Ovalle, Luis (Investigador/a)
  • Alberto Luna Fernandez (Investigador/a)
  • Bazil Taha Ahmed (Investigador/a)
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Ejecución: 01-04-2013 - 30-09-2015

Tipo: Regional

Importe financiado: 28,00 Euros.

  • iMarina

Regiones recurrentes y paisajes genomicos y epigenéticos: Integración con árboles oncogenéticos.

  • Jose Costa (Investigador/a)
  • Paul Lizardi (Investigador/a)
  • Daniel Rico Rodriguez (Investigador/a)
  • Diaz Uriarte, Ramon (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-01-2010 - 31-12-2013

  • iMarina

Desarrollo de métodos estadísticos para el análisis conjunto de arrays de CGH y arrays de expresión génica para el estudio de neoplasias humanas: Fundación Mutua Madrileña

  • Diaz Uriarte, Ramon (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-01-2005 - 01-01-2008

  • iMarina

Extracción de conocimiento de los microarrays de ADN usando métodos estadísticos

  • Diaz Uriarte, Ramon (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-01-2003 - 01-01-2006

  • iMarina

Developing drug prioritization approaches to target cancer genomes for precisión medicine

  • Al-Shahrour Núñez, Fátima (Director)
  • Diaz Uriarte, Ramon (Tutor) Doctorando: Piñeiro Yáñez, Elena

28/4/2021

  • iMarina

Analysis of the impact of population copy number variation in introns

  • Valencia Herrera, Alfonso (Director)
  • Rico Rodríguez, Daniel (Director)
  • Diaz Uriarte, Ramon (Tutor) Doctorando: Rigau de Llobet, María

21/6/2019

  • iMarina

Modelización computacional de las alteraciones metabólicas en cáncer de mama

  • Diaz Uriarte, Ramon (Director)
  • Gámez Pozo, Angelo (Director) Doctorando: Trilla Fuertes, Lucía

28/3/2019

  • iMarina

Computational approaches for the identification of putative therapeutic targets for pancreatic ductal adenocarcinoma

  • Al-Shahrour Núñez, Fátima (Supervisor)
  • Valencia Herrera, Alfonso (Supervisor)
  • Diaz Uriarte, Ramon (Tutor)

13/12/2019

  • iMarina

Statistical methods for the analysis of copy number alterations in the genome

  • Diaz Uriarte, Ramon (Director) Doctorando: Rueda Palacio, Oscar Manuel

19/12/2008

  • iMarina

Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.

Última actualización de los datos: 20/04/22 10:20