Huerta Cepas, Jaime j.huerta@upm.es

Actividades

Discovery of antimicrobial peptides in the global microbiome with machine learning

  • Santos-Junior, Celio Dias
  • Torres, Marcelo D T
  • Duan, Yiqian
  • del Rio, Alvaro Rodriguez
  • Schmidt, Thomas S B
  • Chong, Hui
  • Fullam, Anthony
  • Kuhn, Michael
  • Zhu, Chengkai
  • Houseman, Amy
  • Somborski, Jelena
  • Vines, Anna
  • Zhao, Xing-Ming
  • Bork, Peer
  • Huerta-Cepas, Jaime
  • de la Fuente-Nunez, Cesar
  • Coelho, Luis Pedro
... Ver más Contraer

Cell - 11/7/2024

10.1016/j.cell.2024.05.013

  • ISSN 00928674
  • iMarina

Expanded phylogeny of extremely halophilic archaea shows multiple independent adaptations to hypersaline environments

  • Baker BA
  • Gutiérrez-Preciado A
  • Rodríguez del Río Á
  • McCarthy CGP
  • López-García P
  • Huerta-Cepas J
  • Susko E
  • Roger AJ
  • Eme L
  • Moreira D
... Ver más Contraer

Nature Microbiology (p. 964-975) - 22/3/2024

10.1038/s41564-024-01647-4 Ver en origen

  • ISSN 20585276

A global survey of prokaryotic genomes reveals the eco-evolutionary pressures driving horizontal gene transfer

  • Dmitrijeva M
  • Tackmann J
  • Matias Rodrigues JF
  • Huerta-Cepas J
  • Coelho LP
  • von Mering C

Nature Ecology & Evolution (p. 986-998) - 5/3/2024

10.1038/s41559-024-02357-0 Ver en origen

  • ISSN 2397334X

Functional and evolutionary significance of unknown genes from uncultivated taxa

  • del Rio, AR
  • Giner-Lamia, J
  • Cantalapiedra, CP
  • Botas, J
  • Deng, ZQ
  • Hernandez-Plaza, A
  • Munar-Palmer, M
  • Santamaria-Hernando, S
  • Rodriguez-Herva, JJ
  • Ruscheweyh, HJ
  • Paoli, L
  • Schmidt, TSB
  • Sunagawa, S
  • Bork, P
  • Lopez-Solanilla, E
  • Coelho, LP
  • Huerta-Cepas, J
... Ver más Contraer

Nature (p. 377-384) - 8/2/2024

10.1038/s41586-023-06955-z Ver en origen

  • ISSN 00280836

Quest for Orthologs in the Era of Biodiversity Genomics

  • Langschied, Felix
  • Bordin, Nicola
  • Cosentino, Salvatore
  • Fuentes-Palacios, Diego
  • Glover, Natasha
  • Hiller, Michael
  • Hu, Yanhui
  • Huerta-Cepas, Jaime
  • Coelho, Luis Pedro
  • Iwasaki, Wataru
  • Majidian, Sina
  • Manzano-Morales, Saioa
  • Persson, Emma
  • Richards, Thomas A
  • Gabaldon, Toni
  • Sonnhammer, Erik
  • Thomas, Paul D
  • Dessimoz, Christophe
  • Ebersberger, Ingo
... Ver más Contraer

Genome Biology And Evolution - 30/10/2024

10.1093/gbe/evae224

  • ISSN 17596653
  • iMarina

Fecal microbiota transplantation alters the proteomic landscape of inflammation in HIV: identifying bacterial drivers

  • Diaz-Garcia, Claudio
  • Moreno, Elena
  • Talavera-Rodriguez, Alba
  • Martin-Fernandez, Lucia
  • Gonzalez-Bodi, Sara
  • Martin-Pedraza, Laura
  • Perez-Molina, Jose A
  • Dronda, Fernando
  • Gosalbes, Maria Jose
  • Luna, Laura
  • Vivancos, Maria Jesus
  • Huerta-Cepas, Jaime
  • Moreno, Santiago
  • Serrano-Villar, Sergio
... Ver más Contraer

Microbiome - 22/10/2024

10.1186/s40168-024-01919-5

  • ISSN 20492618
  • iMarina

Exploring the sediment-associated microbiota of the Mar Menor coastal lagoon

  • Giner-Lamia, J
  • Huerta-Cepas, J

Frontiers In Marine Science - 23/1/2024

10.3389/fmars.2024.1319961 Ver en origen

  • ISSN 22967745

Computational exploration of the global microbiome for antibiotic discovery.

  • Santos-Júnior CD
  • Der Torossian Torres M
  • Duan Y
  • Del Río ÁR
  • Schmidt TSB
  • Chong H
  • Fullam A
  • Kuhn M
  • Zhu C
  • Houseman A
  • Somborski J
  • Vines A
  • Zhao XM
  • Bork P
  • Huerta-Cepas J
  • de la Fuente-Nunez C
  • Coelho LP
... Ver más Contraer

11/9/2023

10.1101/2023.08.31.555663

  • iMarina

Atlas of mRNA translation and decay for bacteria

  • Huch, S
  • Nersisyan, L
  • Ropat, M
  • Barrett, D
  • Wu, MJ
  • Wang, J
  • Valeriano, VD
  • Vardazaryan, N
  • Huerta-Cepas, J
  • Wei, W
  • Du, J
  • Steinmetz, LM
  • Engstrand, L
  • Pelechano, V
... Ver más Contraer

Nature Microbiology (p. 1123-1136) - 1/6/2023

10.1038/s41564-023-01393-z Ver en origen

  • ISSN 20585276

eggNOG 6.0: enabling comparative genomics across 12 535 organisms

  • Hernandez-Plaza, Ana
  • Szklarczyk, Damian
  • Botas, Jorge
  • Cantalapiedra, Carlos P.
  • Giner-Lamia, Joaquin
  • Mende, Daniel R.
  • Kirsch, Rebecca
  • Rattei, Thomas
  • Letunic, Ivica
  • Jensen, Lars J.
  • Bork, Peer
  • von Mering, Christian
  • Huerta-Cepas, Jaime;
... Ver más Contraer

Nucleic Acids Research (p. D389-D394) - 6/1/2023

10.1093/nar/gkac1022 Ver en origen

  • ISSN 03051048

Este/a investigador/a no tiene libros.

Este/a investigador/a no tiene capítulos de libro.

Automatic prediction of the genetic code

  • Patricio M
  • Huerta-Cepas J
  • Gabaldón T
  • Zardoya R
  • Posada D

Lecture Notes In Computer Science (p. 1125-1129) - 1/1/2009

10.1007/978-3-642-02481-8_170 Ver en origen

  • ISSN 03029743

Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.

Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.

RESUME THE SEARCH OF THE FUNGUS SPECIES IN SAMPLES FROM USA, PROYECTO ABIERTO

  • HUERTA CEPAS, JAIME (Colaborador/a)
  • PEREZ CANTALAPIEDRA, CARLOS (Investigador principal (IP))

Ejecución: 09-01-2024 - 08-07-2024

Tipo: Interno

  • iMarina

SEARCH IN FUNGAL DATABASES USING A PRE ASSEMBLED AND ANNOTATED REFERENCED GENOME

  • HUERTA CEPAS, JAIME (Colaborador/a)
  • PEREZ CANTALAPIEDRA, CARLOS (Investigador principal (IP))

Ejecución: 08-06-2023 - 08-12-2023

Tipo: Interno

  • iMarina

Hub de Innovación Digital en Inteligencia Artificial y Robótica para los Objetivos de Desarrollo Sostenible

  • GONZALEZ BODI, SARA (Participante)
  • LARRAÑAGA MUGICA, PEDRO MARIA (Participante)
  • BARRIENTOS CRUZ, ANTONIO (Participante)
  • BIELZA LOZOYA, MARIA CONCEPCION (Participante)
  • CERRO GINER, JAIME DEL (Participante)
  • GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Participante)
  • MARTINEZ GAMERO, ROBERTO (Participante)
  • VALLE FERNáNDEZ, ROBERTO (Participante)
  • LUCAS DEL POZO, MIGUEL ANGEL (Participante)
  • Molina González, Martín (Participante)
  • GOMEZ PEREZ, ASUNCION DE MARIA (Investigador principal (IP))
  • MIHALJEVIC, BOJAN (Participante)
  • FERRE GRAU, XAVIER (Participante)
  • MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO (Participante)
  • Salgado Alvarez de Sotomayor, Luis (Participante)
  • SENRA DIAZ, ARISTIDES (Participante)
  • MARTINEZ SALLES, IVAN (Participante)
  • AGUILERA BENITO, PATRICIA (Participante)
  • CABEZAS TEJERO, ISMAEL (Participante)
  • CUBEIRO ESPINOSA, BEATRIZ (Participante)
  • BERMEJO NIETO, ANA BELEN (Participante)
  • JIMENEZ MARTIN, ANTONIO (Participante)
  • RODRIGUEZ DONCEL, VICTOR (Participante)
  • Corcho García, Oscar (Participante)
  • MATEOS CABALLERO, ALFONSO (Participante)
  • MORENO DIAZ, ARMINDA (Participante)
  • GARCIA ARES, BIENVENIDO (Participante)
  • Amigo Rodríguez, Ana (Participante)
  • MUÑOZ PORTA, DACIL ISABEL (Participante)
  • FERRE PEREZ, MANUEL (Participante)
  • MUÑOZ GUIJOSA, JUAN MANUEL (Participante)
  • HUERTA CEPAS, JAIME (Participante)
... Ver más Contraer

Ejecución: 29-11-2021 - 30-06-2023

  • iMarina

ETE Toolkit: Phylogenomic data analysis and visualization

  • MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO (Investigador principal (IP))
  • HUERTA CEPAS, JAIME (Participante)

Ejecución: 01-07-2020 - 31-12-2021

Tipo: Internacional

Importe financiado: 73700,00 Euros.

  • iMarina

Investigación y desarrollo de soluciones tecnológicas basadas en el microbioma implicado en el procesado de los residuos sólidos urbanos (MICROUWAS-BIO)

  • LÓPEZ GARCÍA, GEMMA (Participante)
  • SOUSARAEI, NAEIMEH (Participante)
  • MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO (Investigador principal (IP))
  • HUERTA CEPAS, JAIME (Participante)

Ejecución: 01-10-2020 - 31-03-2023

Tipo: Nacional

  • iMarina

CHARGEREEN

  • MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO (Investigador principal (IP))
  • HUERTA CEPAS, JAIME (Colaborador/a)
  • RUBIO HERRERO, LUIS MANUEL (Colaborador/a)

Ejecución: 01-07-2019 - 31-12-2019

Tipo: Interno

  • iMarina

Comparative Genomics of Environmental DNA : Functional, Ecological and Evolutionary Characterization of Genes from Uncultivated Taxa

  • HUERTA CEPAS, JAIME (Director) Doctorando: Rodríguez del Río, Álvaro

7/6/2022

  • iMarina

Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.

Última actualización de los datos: 1/12/24 11:19