Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es
Actividades
- Artículos 77
- Libros 0
- Capítulos de libro 5
- Congresos 41
- Documentos de trabajo 0
- Informes técnicos 0
- Proyectos de investigación 18
- Tesis dirigidas 13
- Patentes o licencias de software 0
DNMG: Deep molecular generative model by fusion of 3D information for de novo drug design
- Song, Tao
- Ren, Yongqi
- Wang, Shuang
- Han, Peifu
- Wang, Lulu
- Li, Xue
- Rodriguez-Paton, Alfonso
Methods (p. 10-22) - 1/3/2023
10.1016/j.ymeth.2023.02.001 Ver en origen
- ISSN 10462023
BioBlocksLab: A portable DIY Bio Lab using BioBlocks language
- Ma, TM
- Méndez-Merino, D
- Uría-Regojo, G
- Sánchez-Fernández, C
- Giner-Sánchez, L
- Guerrero-Aspizua, S
- Quílez-López, C
- Rodríguez-Patón, A
Methods (p. 36-43) - 1/2/2023
10.1016/j.ymeth.2023.01.001 Ver en origen
- ISSN 10462023
Will data analytics revolution finally bring SERS to the clinic?
- Mahmoud, AYF
- Teixeira, A
- Aranda, M
- Relvas, MS
- Quintero, S
- Sousa-Silva, M
- Chícharo, A
- Chen, MK
- Hashemi, M
- King, JB
- Tunnell, JW
- Morasso, C
- Piccotti, F
- Corsi, F
- Henriksen-Lacey, M
- Aberasturi, DJD
- Méndez-Merino, D
- Rodríguez-Patón, A
- Abalde-Cela, S
- Diéguez, L
Trac-Trends In Analytical Chemistry - 1/12/2023
10.1016/j.trac.2023.117311 Ver en origen
- ISSN 01659936
PETrans: De Novo Drug Design with Protein-Specific Encoding Based on Transfer Learning
International Journal Of Molecular Sciences - 1/1/2023
10.3390/ijms24021146 Ver en origen
- ISSN 14220067
MARPPI: boosting prediction of protein-protein interactions with multi-scale architecture residual network
- Li, Xue
- Han, Peifu
- Chen, Wenqi
- Gao, Changnan
- Wang, Shuang
- Song, Tao
- Niu, Muyuan
- Rodriguez-Paton, Alfonso
Briefings In Bioinformatics - 1/1/2023
10.1093/bib/bbac524 Ver en origen
- ISSN 14675463
Molormer: a lightweight self-attention-based method focused on spatial structure of molecular graph for drug-drug interactions prediction
Briefings In Bioinformatics - 19/7/2022
10.1093/bib/bbac296 Ver en origen
- ISSN 14675463
KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions
- Wang, Shudong
- Du, Zhenzhen
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao
Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022
10.1007/s10489-021-02454-8 Ver en origen
- ISSN 0924669X
Network-Based Approaches for Drug Repositioning
- Song, Tao
- Wang, Gan
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Wang, Xun
- Wang, Shudong
Molecular Informatics - 1/1/2022
10.1002/minf.202100200 Ver en origen
- ISSN 18681743
AMDE: a novel attention-mechanism-based multidimensional feature encoder for drug-drug interaction prediction
- Pang, Shanchen
- Zhang, Ying
- Song, Tao
- Zhang, Xudong
- Wang, Xun
- Rodriguez-Paton, Alfonso
Briefings In Bioinformatics - 1/1/2022
10.1093/bib/bbab545 Ver en origen
- ISSN 14675463
DeepFusion: A deep learning based multi-scale feature fusion method for predicting drug-target interactions
- Song, Tao
- Zhang, Xudong
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Wang, Shudong
- Wang, Gan
Methods (p. 269-277) - 1/1/2022
10.1016/j.ymeth.2022.02.007 Ver en origen
- ISSN 10462023
Este/a investigador/a no tiene libros.
An implementation of elementary arithmetic with virus machine
- Yan X
- Liu X
- Zeng X
- Rodríguez-Patón A
Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018
10.1007/978-3-030-00265-7_24 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Petr Sosík
- Ludek Cienciala
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010
- iMarina
Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes
- Petr Sosík
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Lucie Ciencialová
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010
- iMarina
Biomolecular computing devices in synthetic biology
- Miró J
- Rodríguez-Patón A
Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008
Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques
- Manrique D
- Ríos J
- Rodríguez-Patón A
Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005
LDCNN-DTI: A Novel Light Deep Convolutional Neural Network for Drug-Target Interaction Predictions
- Wang, Shudong
- Du, Zhenzhen
- Ding, Mao
- Zhao, Renteng
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao
2007 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Proceedings (p. 1132-1136) - 1/1/2020
10.1109/bibm49941.2020.9313585 Ver en origen
- ISSN 21561125
LncRNA-disease association prediction based on neighborhood information aggregation in neural network
- Chen, Hongjie
- Zhang, Xuan
- Song, Tao
- Wang, Xun
- Zeng, Xiangxiang
- Rodriguez-Paton, Alfonso
Proceedings - 2018 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2018 (p. 175-178) - 21/1/2019
10.1109/bibm.2018.8621441 Ver en origen
- ISSN 21561133
- iMarina
- iMarina
An auxin hormone - signaling factors oscillator regulates time-dependent branching in the Arabidopsis root
- Marcos Rodriguez
- Juan Perianez-Rodriguez
- Juan Carlos del Pozo
- Angela Saez
- SANCHEZ CORRIONERO, ALVARO
- BUSTILLO AVENDAÑO, ESTEFANO
- MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Libro De Resumenes Del Xv Simposio De Fitohormonas De La Sociedad Española De Fisiología Vegetal (p. 28-28) - 13/12/2018
- iMarina
Iteratively collective prediction of disease-gene associations through the incomplete network
- Xiangyi Meng
- Quan Zou
- ZENG, XIANGXIANG
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Proceedings - 2017 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2017 (p. 1324-1330) - 15/12/2017
10.1109/bibm.2017.8217854 Ver en origen
- iMarina
- iMarina
Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator
- Gutierrez, Martin
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Fourteenth European Conference On Artificial Life (Ecal 2017) (p. 186-187) - 1/1/2017
- iMarina
Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator
- Gutiérrez M
- Rodríguez-Patón A
Proceedings Of The 14th European Conference On Artificial Life, Ecal 2017 (p. 186-187) - 1/1/2017
- iMarina
BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences
- Jesus Irimia
- Gupta, Vishal
- PAU DE LA CRUZ, IVAN
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016
- iMarina
BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation
- Prestes Garcia, Antonio
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015
10.1007/978-3-319-18944-4_26 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation
- García A
- Rodríguez-Patón A
A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015
10.1007/978-3-319-19776-0_1 Ver en origen
- ISSN 21945357
- iMarina
- iMarina
Probabilistic reasoning with an enzyme-driven DNA device
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Lecture Notes In Computer Science (p. 160-173) - 2/12/2013
10.1007/978-3-319-01928-4_12 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.
Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.
Multimodal Hypersprectal Imaging and Raman Spectroscopy for Intraoperative Assessment of Breast Tumor Resection Margins
- , (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-12-2024 - 30-11-2028
Tipo: Internacional
Importe financiado: 343000,00 Euros.
- iMarina
Descifrando las infecciones bacterianas con técnicas de inteligencia artificial e ingeniería de biocircuitos
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- Mitrana, Victor (Participante)
- SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- LEON PRIETO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
Ejecución: 01-09-2023 - 31-08-2026
Tipo: Nacional
- iMarina
Interacción longitudinal de datos generados por paciente y determinaciones multi-ómicas para una oncología de precisión integral en cáncer de la mujer
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-01-2023 - 31-12-2025
Tipo: Nacional
Importe financiado: 132000,00 Euros.
- iMarina
Placing the T3SS effector-network paradigm within a systems level understanding of in vivo infection
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 02-05-2022 - 01-05-2027
Tipo: Internacional
- iMarina
APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL
- GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 06-04-2022 - 24-07-2022
Tipo: Interno
- iMarina
Ultrasensitive BIOsensing platform for multiplex CELLular protein PHEnotyping at single-cell level
- LEON PRIETO, LUCIA (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-04-2021 - 31-03-2025
Tipo: Internacional
Importe financiado: 303250,00 Euros.
- iMarina
Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Mitrana, Victor (Participante)
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Participante)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
Ejecución: 01-06-2020 - 31-05-2023
Tipo: Nacional
Importe financiado: 87120,00 Euros.
- iMarina
PROgramable living drugs engineering MIcrobial CELLS
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-06-2019 - 31-05-2021
Tipo: Nacional
Importe financiado: 24700,00 Euros.
- iMarina
LIA. Ingeniería microbiana, salud y calidad de vida.
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- SONG, TAO (Participante)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Participante)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Participante)
- ZENG, XIANGXIANG (Participante)
Ejecución: 01-01-2018 - 30-06-2022
Tipo: Regional
Importe financiado: 29881,60 Euros.
- iMarina
Programming biology with bioblocks in an open portable bio lab
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Ma, Tongmao
30/1/2024
- iMarina
Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos
1/1/2021
- iMarina
Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
- PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula
1/1/2018
- iMarina
Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein
1/1/2017
- iMarina
An end-to-end solution for automation of biological protocols
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal
1/1/2017
- iMarina
Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio
1/1/2017
- iMarina
A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo
1/1/2017
- iMarina
Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David
1/1/2016
- iMarina
Inference Models in DNA Computing
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes
1/1/2013
- iMarina
Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.
Grupos de investigación
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Grupo de Inteligencia Artificial (LIA)
Rol: Investigador Principal
Perfiles de investigador/a
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