Rauer, Clemens clemens.rauer@uam.es
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Clustering protein functional families at large scale with hierarchical approaches
- Bordin, Nicola
- Scholes, Harry
- Rauer, Clemens
- Roca-Martinez, Joel
- Sillitoe, Ian
- Orengo, Christine
Protein Science - 1/9/2024
- ISSN 09618368
- iMarina
Novel machine learning approaches revolutionize protein knowledge
- Bordin, N.
- Dallago, C.
- Heinzinger, M.
- Kim, S.
- Littmann, M.
- Rauer, C.
- Steinegger, M.
- Rost, B.
- Orengo, C.
Trends In Biochemical Sciences (p. 345-359) - 1/4/2023
10.1016/j.tibs.2022.11.001 Ver en origen
- ISSN 09680004
AlphaFold2 reveals commonalities and novelties in protein structure space for 21 model organisms
- Bordin, N.
- Sillitoe, I.
- Nallapareddy, V.
- Rauer, C.
- Lam, S.D.
- Waman, V.P.
- Sen, N.
- Heinzinger, M.
- Littmann, M.
- Kim, S.
- Velankar, S.
- Steinegger, M.
- Rost, B.
- Orengo, C.
Commun Biol - 1/12/2023
10.1038/s42003-023-04488-9 Ver en origen
- ISSN 23993642
Computational approaches to predict protein functional families and functional sites
- Rauer, Clemens
- Sen, Neeladri
- Waman, P. Vaishali
- Abbasian, Mahnaz
- Orengo, A. Christine;
Current Opinion In Structural Biology (p. 108-122) - 1/10/2021
10.1016/j.sbi.2021.05.012 Ver en origen
- ISSN 0959440X
CATH: increased structural coverage of functional space
- Sillitoe, Ian
- Bordin, Nicola
- Dawson, Natalie
- Waman, Vaishali P.
- Ashford, Paul
- Scholes, Harry M.
- Pang, Camilla S. M.
- Woodridge, Laurel
- Rauer, Clemens
- Sen, Neeladri
- Abbasian, Mahnaz
- Le Cornu, Sean
- Lam, Su Datt
- Berka, Karel
- Varekova, Ivana Hutarova
- Svobodova, Radka
- Lees, Jon
- Orengo, Christine A.;
Nucleic Acids Research (p. D266-D273) - 8/1/2021
10.1093/nar/gkaa1079 Ver en origen
- ISSN 03051048
Hydration free energies from kernel-based machine learning: Compound-database bias
- Rauer, Clemens
- Bereau, Tristan;
Journal Of Chemical Physics - 7/7/2020
10.1063/5.0012230 Ver en origen
- ISSN 00219606
SARS-CoV-2 spike protein predicted to form complexes with host receptor protein orthologues from a broad range of mammals
- Lam, S. D.
- Bordin, N.
- Waman, V. P.
- Scholes, H. M.
- Ashford, P.
- Sen, N.
- van Dorp, L.
- Rauer, C.
- Dawson, N. L.
- Pang, C. S. M.
- Abbasian, M.
- Sillitoe, I
- Edwards, S. J. L.
- Fraternali, F.
- Lees, J. G.
- Santini, J. M.
- Orengo, C. A.;
Scientific Reports - 1/12/2020
10.1038/s41598-020-71936-5 Ver en origen
- ISSN 20452322
Stepwise photosensitized thymine dimerization mediated by an exciton intermediate
- Rauer, Clemens
- Nogueira, Juan J
- Marquetand, Philipp
- Gonzalez, Leticia
Monatshefte Fur Chemie (p. 1-9) - 1/1/2018
10.1007/s00706-017-2108-4 Ver en origen
- ISSN 00269247
Communication: GAIMS-Generalized Ab Initio Multiple Spawning for both internal conversion and intersystem crossing processes
- Curchod, Basile F. E.
- Rauer, Clemens
- Marquetand, Philipp
- Gonzalez, Leticia
- Martinez, Todd J.;
Journal Of Chemical Physics - 14/3/2016
10.1063/1.4943571 Ver en origen
- ISSN 00219606
Cyclobutane Thymine Photodimerization Mechanism Revealed by Nonadiabatic Molecular Dynamics
- Rauer, Clemens
- Nogueira, Juan J
- Marquetand, Philipp
- Gonzalez, Leticia
Journal Of The American Chemical Society (p. 15911-15916) - 14/12/2016
10.1021/jacs.6b06701 Ver en origen
- ISSN 00027863
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