Los datos mostrados de la Universidad Carlos III de Madrid son parciales, pues con ellos se pretende responder a 2 preguntas:

  • ¿Quién investiga un tema concreto?
  • ¿Qué investiga un/a investigador/a, grupo o departamento específico?

Por esta razón sólo recoge investigadores/as en activo.

Además, sólo se recogen los resultados de investigación siguiendo estos límites:

  • Proyectos de investigación desde 2006.
  • Publicaciones, Tesis doctorales, Patentes y Software desde 2008.
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Perfil en el portal institucional

Muñoz Barrutia, Maria Arrate mamunozb@ing.uc3m.es

Bioingeniería e Ingeniería Aeroespacial / Universidad Carlos III de Madrid

Actividades

DeepImageJ: A user-friendly environment to run deep learning models in ImageJ

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Garcia Lopez De Haro, Carlos Javier
  • Ouyang, Wei
  • Donati, Laurene
  • Lundberg, Emma
  • Unser, Michael
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Sage, Daniel
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bioRxiv - 5/2021

https://doi.org/10.1101/799270 Ver en origen

A radiological score for the assessment of tuberculosis progression: Validation in mouse models

  • Ortega Gil, Ana
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Roca, Jose Juan
  • Guijarro-lopez, Laura
  • Vaquero Lopez, Juan Jose

Tuberculosis - 3/2020

https://doi.org/10.1016/j.tube.2020.101918 Ver en origen

  • EISSN 1873-281X
  • ISSN 1472-9792
Open Access

ABANICCO: A New Color Space for Multi-Label Pixel Classification and Color Analysis

  • Nicolas Saenz, Laura
  • Ledezma Espino, Agapito Ismael
  • Pascau Gonzalez Garzon, Javier
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Sensors (p. 1-23) - 3/2023

https://doi.org/10.3390/s23063338 Ver en origen

  • EISSN 1424-8220
  • ISSN 1424-3210
Open Access

Development of an Inverted Epifluorescence Microscope for Long-Term Monitoring of Bacteria in Multiplexed Microfluidic Devices

  • Torres Simon, Amaro
  • Marino Miguelez, Maria Henar
  • Gomez Cruz, Clara
  • Cañadas Ortega, Marina
  • Marco Esteban, Miguel
  • Ripoll Lorenzo, Jorge
  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
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Sensors (p. 1-14) - 8/2020

https://doi.org/10.3390/s20154140 Ver en origen

  • EISSN 1424-8220
  • ISSN 1424-3210
Open Access

X-ray-based virtual slicing of TB-infected lungs

  • Ortega Gil, Ana
  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Gonzalez Arjona, Mario
  • Rullas, Joaquín
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Scientific Reports (p. 19404) - 12/2019

https://doi.org/10.1038/s41598-019-55986-y Ver en origen

  • ISSN 2045-2322
Open Access

Use of the p-values as a size-dependent function to address practical differences when analyzing large datasets

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Guerrero Lozano, Vanesa
  • Sneider, Alexandra
  • Jayatilaka, Hasini
  • Phillip, Jude M.
  • Wirtz, Denis
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
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Scientific Reports (p. 1-13) - 10/2021

https://doi.org/10.1038/s41598-021-00199-5 Ver en origen

  • ISSN 2045-2322
Open Access

Predicting MHC I restricted T cell epitopes in mice with NAP-CNB, a novel online tool

  • Wert Carvajal, Carlos
  • Sánchez García, Rubén
  • Macías, José R.
  • Sanz Pamplona, Rebeca
  • Méndez Pérez, Almudena
  • Alemany, Ramon
  • Veiga, Esteban
  • Sorzano, Carlos Óscar S.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
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Scientific Reports (p. 1-10) - 5/2021

10.1038/s41598-021-89927-5 Ver en origen

  • ISSN 2045-2322
Open Access

Unsupervised CT lung image segmentation of a mycobacterium tuberculosis infection model

  • Macias Gordaliza, Pedro
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Abella Garcia, Monica
  • Desco Menendez, Manuel
  • Sharpe, Sally
  • Vaquero Lopez, Juan Jose

Scientific Reports (p. 1-10) - 6/2018

https://doi.org/10.1038/s41598-018-28100-x Ver en origen

  • ISSN 2045-2322
Open Access

Deep-learning-based segmentation of small extracellular vesicles in transmission electron microscopy images

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Maška, Martin
  • Kotrbová, Anna
  • Pospíchalová, Vendula
  • Matula, Pavel
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Scientific Reports (p. 1-10) - 9/2019

https://doi.org/10.1038/s41598-019-49431-3 Ver en origen

  • ISSN 2045-2322
Open Access

Innovations in ex vivo Light Sheet Fluorescence Microscopy

  • Delgado Rodriguez, Pablo
  • Brooks, Claire Jordan
  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

PROGRESS IN BIOPHYSICS & MOLECULAR BIOLOGY (p. 37-51) - 1/2022

https://doi.org/10.1016/j.pbiomolbio.2021.07.002 Ver en origen

  • EISSN 1873-1732
  • ISSN 0079-6107

Este/a investigador/a no tiene libros.

Open Access

Acquisition and Automated Analysis of Normal and Pathological Lungs in Small Animals Using Microcomputed Tomography. In: Lung Imaging and Computer Aided Diagnosis

  • Artaechevarria, X.
  • Ceresa, M.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Ortiz De Solórzano, Carlos

Lung Imaging and Computer Aided Diagnosis (p. 137-150) - 4/2016

Editor: CRC PRESS

  • ISBN 978-1-4398-4558-5

Emerging technologies and outlook. In: ImagingModalitiesforBiological andPreclinicalResearch: ACompendium,Volume2 Parts II&-IV: In vivo preclinical imaging, multimodality imaging and outlook

  • Walter, Andreas
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Jones, Martin
  • Mannheim, Julia G
  • Collinson, Lucy
  • Andreana, Marco
  • Unterhuber, Angelika
  • Verkade, Paul
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ImagingModalitiesforBiological andPreclinicalResearch: ACompendium,Volume2 Parts II&-IV: In vivo preclinical imaging, multimodality imaging and outlook (p. V.1-1-IV.1-14) - 5/2021

Editor: IOP PUBLISHING LTD

https://doi.org/10.1088/978-0-7503-3747-2ch31 Ver en origen

  • ISBN 978-0-7503-3747-2
Open Access

Building a bioimage analysis workflow using deep learning. In: Bioimage data analysis workflows ¿ Advanced components and methods

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Franco Barranco, Daniel
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Arganda Carreras, Ignacio

Bioimage data analysis workflows ¿ Advanced components and methods (p. 61-87) - 9/2022

Editor: Springer Berlin / Heidelberg

https://doi.org/10.1007/978-3-030-76394-7_4 Ver en origen

  • ISBN 978-3-030-76394-7

Automatic leakage detection and recovery for airway tree extraction in chest CT images

  • Ceresa, M.
  • Artaechevarria, X.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Ortiz De Solórzano, Carlos

ISBI 2010: 7th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (p. 568-571) - 2010

Editor: IEEE.THE INSTITUTE OF ELECTRICAL AND ELECTRONICS ENGINEERS, INC

https://doi.org/10.1109/isbi.2010.5490282 Ver en origen

  • ISBN 978-1-4244-4125-9

Fast detection of cells using a continuously scalable Mexican-hat-like template

  • Chaudhury, K.n.
  • Püspöki, Zs.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Sage, D.
  • Unser, M.

ISBI 2010: 2013 7th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (p. 1277-1280) - 2010

Editor: IEEE.THE INSTITUTE OF ELECTRICAL AND ELECTRONICS ENGINEERS, INC

https://doi.org/10.1109/isbi.2010.5490229 Ver en origen

  • ISBN 978-1-4244-4125-9

Super-Resolved<br/>Traction Foce Microscopy Over Whole Cells

  • Suñe Auñon, Alejandro
  • Peñas, Alvaro Jorge
  • Van Oosterwyck, H.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (p. 40-43) - 2017

Editor: IEEE Computer Society.

https://doi.org/10.1109/isbi.2017.7950463 Ver en origen

  • ISBN 1945-8452

Automatic Segmentation of Cell Protrusions in Low Magnification Phase Contrast Microscopy Videos

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Jayatilaka, Hasini
  • Kim, Hyun Ji
  • Tyle, Pranay
  • Matsuda, Max
  • Wirtz, Denis
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
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IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2018) - 2018

QUANTIFICATION OF THE 3D COLLAGEN NETWORK GEOMETRY IN CONFOCAL REFLECTION MICROSCOPY

  • Maška, M.
  • Ederra, C.
  • Fernández-marqués, J.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Kozubek, Michal
  • Ortiz De Solórzano, Carlos

IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2015 (p. 1791-1794) - 2015

Editor: IEEE.THE INSTITUTE OF ELECTRICAL AND ELECTRONICS ENGINEERS, INC

https://doi.org/10.1109/icip.2015.7351109 Ver en origen

  • ISBN 978-1-4799-8339-1/15/
Open Access

Radiomics for the Discrimination of Tuberculosis Lesions

  • Macias Gordaliza, Pedro
  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Sharpe, Sally
  • Desco Menendez, Manuel
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

European Molecular Imaging Meeting (EMIM 2018) - 2018

Open Access

Spectral photon-counting CT of lungs of mice infected with Mycobacterium Tuberculosis: potential for locating Tuberculosis involvement

  • Ortega Gil, Ana
  • Moghiseh, M.
  • Lowe, C.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Raja, A.
  • Butler, A.p.h.
  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Anderson, N.g.
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European Molecular Imaging Meeting (EMIM 2018) - 2018

Tuberculosis Histopathology on X Ray CT

  • Ortega Gil, Ana
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Fernandez Terron, Laura
  • Vaquero Lopez, Juan Jose

3rd International Workshop on Reconstruction and Analysis of Moving Body Organs, RAMBO 2018, 4th International Workshop on Breast Image Analysis, BIA 2018, and 1st International Workshop on Thoracic Image Analysis, TIA 2018, held in conjunction with 21st International Conference on Medical Imaging and Computer-Assisted Intervention, MICCAI 2018 (p. 169-179) - 2018

Editor: SPRINGER NATURE LIMITED

https://doi.org/10.1007/978-3-030-00946-5_18 Ver en origen

  • ISBN 978-3-030-00945-8

Characterization of the Role of Collagen Network Structure and Composition in Cancer Cell Migration

  • Anguiano, M.
  • Castilla, C.
  • Maska, Martin
  • Ederra, C.
  • Fernández-marqués, J.
  • Pelaez, R.
  • Rouzaut, A.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Kozubek, Michal
  • Ortiz De Solórzano, Carlos
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37TH ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2015) (p. 8139-8142) - 2015

Editor: IEEE.THE INSTITUTE OF ELECTRICAL AND ELECTRONICS ENGINEERS, INC

https://doi.org/10.1109/embc.2015.7320283 Ver en origen

  • ISBN 978-1-4244-9270-1/15/

Fully Automatic Segmentation of Exosomes in Transmission Electron Microscopy

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Maska, Martin
  • Kotrova, A.
  • Pospichalova, V.
  • Matula, P.
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

2nd Joint Meeting of REMOA and PPB Spanish Portuguese Meeting for Advanced Optical Microscopy (SPAOM2018) - 2018

  • ISBN 86

Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.

Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.

GA-115337 - PreDict-TB:Model-based preclinical development of anti-tuberculosis drug combinations

  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Toledo Heras, Maria Paula De
  • Desco Menendez, Manuel
  • Pascau Gonzalez Garzon, Javier
  • Sisniega Crespo, Alejandro
  • Chamorro Servent, Judit
  • Perez-juste Abascal, Juan Felipe
  • Abella Garcia, Monica
  • Lopez Sanchez, Luisa Maria
  • Ripoll Lorenzo, Jorge
  • Calle Aurioles, Maria La
  • Chil Perez, Rigoberto
  • Cusso Mula, Lorena
  • Molina Gomez, Claudia De
  • Perez De Isla, Leopoldo
  • Peña Zalbidea, Santiago
  • Ortega Gil, Ana
  • Marcos Vidal, Asier
  • Chil Perez, Rigoberto
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
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Ejecución: 01-05-2012 - 31-10-2017

Tipo: Europeo

Financiado por: EUROPEAN COMMISSION RESEARCH EXECUTIVE AGENCY

947723 - 4D-BIOMAP: Biomechanical Stimulation based on 4D Printed Magneto-Active Polymers

  • Garcia Gonzalez, Daniel
  • Velasco Bayon, Diego
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Garzon Hernandez, Sara
  • Moreno Mateos, Miguel Angel
  • Gomez Cruz, Clara
  • Perez Garcia, Carlos
  • Gonzalez-rico Iriarte, Jorge
  • Lucarini San José, Sergio
  • Lopez Donaire, Maria Luisa
  • Fernandez De La Torre, Miguel
  • Lachowski, Dariusz
  • Rio Hernandez, Armando Emeterio Del
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Ejecución: 01-01-2021 - 31-12-2025

Tipo: Europeo

Financiado por: EUROPEAN COMMISSION RESEARCH EXECUTIVE AGENCY

TEC2016-78052-R - Imagen Paramétrica del Cerebro Embrionario: Una nueva propuesta de instrumentación biomédica de altas prestaciones

  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Ejecución: 30-12-2016 - 31-12-2020

Tipo: Nacional

Financiado por: MINISTERIO DE ECONOMÍA, COMERCIO Y EMPRESA

RTC-2015-3772-1 - Detector DoI-ToF para PET compatible con IRM

  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Perez-juste Abascal, Juan Felipe
  • Chil Perez, Rigoberto
  • Konstantinou, Georgios
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Ejecución: 01-07-2015 - 30-06-2018

Tipo: Nacional

Financiado por: MINISTERIO DE ECONOMÍA, COMERCIO Y EMPRESA

AC20/00102 - Tratamiento personalizado en radioterapia mediante modelado integrado de nuevas restricciones y efectos dosimétricos locales - AC20/00102

  • Pascau Gonzalez Garzon, Javier
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Ejecución: 01-01-2021 - 31-12-2024

Tipo: Nacional

Financiado por: INSTITUTO DE SALUD CARLOS III

PID2019-109820RB-I00 - Plataforma de imagen multi-escala para acelerar el desarrollo de fármacos contra infecciones pulmonares

  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Chil Perez, Rigoberto
  • Lopez Exposito, Patricio Roberto

Ejecución: 01-06-2020 - 29-02-2024

Tipo: Nacional

Financiado por: AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACION (AEI)

Sistema de imagen de tomografía de rayos X para ratones y chips PDMS de microfluídica para estudios de Time Lapse

  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Ortega Gil, Ana
  • Marcos Vidal, Asier
  • Macias Gordaliza, Pedro
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Ejecución: 22-02-2018 - 29-02-2020

Tipo: Regional

Financiado por: GLAXOSMITHKLINE INVESTIGACION Y DESARROLLO, S.L. (GSK)

BIOMASKIN-CM-UM3M - Biocompatible Magneto-Active Structures to Simulate Skin Wound Healing: an Experimental-Computational Coupled Approach

  • Velasco Bayon, Diego
  • Garcia Gonzalez, Daniel
  • Arias Hernandez, Angel
  • Valencia Blanco, Leticia
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Garzon Hernandez, Sara
  • Tirado Garcia, Ignacio
  • Aranda Izuzquiza, Gonzalo De
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Ejecución: 01-01-2020 - 31-03-2022

Tipo: Regional

Financiado por: CAM. CONSEJERÍA DE EDUCACIÓN E INVESTIGACION

GA - 853989 - EUROPEAN REGIMEN ACCELERATOR FOR TUBERCULOSIS

  • Vaquero Lopez, Juan Jose
  • Calderon Mateos, Alejandro
  • Garcia Carballeira, Felix
  • Carretero Perez, Jesus
  • Exposito Singh, David
  • Toledo Heras, Maria Paula De
  • Garcia Blas, Francisco Javier
  • Pascau Gonzalez Garzon, Javier
  • Chil Perez, Rigoberto
  • Macias Gordaliza, Pedro
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Perez Benito, David
  • Sosa Sosa, Victor Jesus
  • Camarmas Alonso, Diego
  • Hidalgo Torres, Leandro Alexis
  • Brooks, Claire Jordan
  • Gomez Cruz, Clara
  • Esarte Araiz, Josu
  • Diaz De Liaño Lopez, Nuria
  • Lopez Exposito, Patricio Roberto
  • Reyes Perez, Eduardo Antonio
  • Ferrer Bazaga, Santiago
  • Visuña Perez, Lara
  • Mendoza Losana, Alfonso
  • Calle Muñoz, Melissa
  • Calvet Seral, Juan
  • Gutierrez De Pablo, Laura
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Ejecución: 01-01-2020 - 31-12-2025

Tipo: Europeo

Financiado por: EUROPEAN COMMISSION RESEARCH EXECUTIVE AGENCY

GA- 801347; GA-801347 - SENSITIVE: Early Detection of cancer onset based on sensing field cancerization at the organ level (conv. H2020-FETOPEN-2016-2017 - Propuesta presentada en septiembre de 2017)

  • Ripoll Lorenzo, Jorge
  • Marcos Vidal, Asier
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate

Ejecución: 01-11-2018 - 31-10-2022

Tipo: Europeo

Financiado por: EUROPEAN COMMISSION RESEARCH EXECUTIVE AGENCY

Computer-Aided Assessment of Tuberculosis with Radiological Imaging: From rule-based methods to Deep Learning

  • Macias Gordaliza, Pedro
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Vaquero Lopez, Juan Jose

Fecha de defensa: 06-05-2022

Insights to the characterization of cell motility and intercellular communication through a bioimage analysis perspective

  • Gomez De Mariscal, Estibaliz
  • Muñoz Barrutia, Maria Arrate
  • Wirtz, Denis

Fecha de defensa: 28-09-2021

Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.

Última actualización de los datos: 7/02/24 8:38