Perez Cantalapiedra, Carlos carlos.cantalapiedra@upm.es
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eggNOG 6.0: enabling comparative genomics across 12 535 organisms
- Hernandez-Plaza, Ana
- Szklarczyk, Damian
- Botas, Jorge
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Giner-Lamia, Joaquin
- Mende, Daniel R.
- Kirsch, Rebecca
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- Letunic, Ivica
- Jensen, Lars J.
- Bork, Peer
- von Mering, Christian
- Huerta-Cepas, Jaime;
Nucleic Acids Research (p. D389-D394) - 6/1/2023
10.1093/nar/gkac1022 View at source
- ISSN 03051048
Towards the biogeography of prokaryotic genes
- Coelho, Luis Pedro
- Alves, Renato
- del Rio, Alvaro Rodriguez
- Myers, Pernille Neve
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Giner-Lamia, Joaquin
- Schmidt, Thomas Sebastian
- Mende, Daniel R.
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- Letunic, Ivica
- Hildebrand, Falk
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- Pan, Shaojun
- Jia, Longhao
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- Sunagawa, Shinichi
- Zhao, Xing-Ming
- Nielsen, Henrik Bjorn
- Huerta-Cepas, Jaime
- Bork, Peer;
Nature (p. 252-256) - 1/1/2022
10.1038/s41586-021-04233-4 View at source
- ISSN 00280836
PhyloCloud: an online platform for making sense of phylogenomic data
- Deng, Ziqi
- Botas, Jorge
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Hernandez-Plaza, Ana
- Burguet-Castell, Jordi
- Huerta-Cepas, Jaime;
Nucleic Acids Research (p. W577-W582) - 1/1/2022
10.1093/nar/gkac324 View at source
- ISSN 03051048
Candidate genes underlying QTL for flowering time and their interactions in a wide spring barley (Hordeum vulgare L.) cross
- Casas AM
- Gazulla CR
- Monteagudo A
- Cantalapiedra CP
- Moralejo M
- Pilar Gracia M
- Ciudad FJ
- Thomas WTB
- Molina-Cano JL
- Boden S
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Crop Journal (p. 862-872) - 1/8/2021
10.1016/j.cj.2020.07.008 View at source
- ISSN 20955421
eggNOG-mapper v2: Functional Annotation, Orthology Assignments, and Domain Prediction at the Metagenomic Scale
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Hernandez-Plaza, Ana
- Letunic, Ivica
- Bork, Peer
- Huerta-Cepas, Jaime;
Molecular Biology And Evolution (p. 5825-5829) - 1/12/2021
10.1093/molbev/msab293 View at source
- ISSN 07374038
Profiling cellular diversity in sponges informs animal cell type and nervous system evolution
- Musser, Jacob M.
- Schippers, Klaske J.
- Nickel, Michael
- Mizzon, Giulia
- Kohn, Andrea B.
- Pape, Constantin
- Ronchi, Paolo
- Papadopoulos, Nikolaos
- Tarashansky, Alexander J.
- Hammel, Jorg U.
- Wolf, Florian
- Liang, Cong
- Hernandez-Plaza, Ana
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Achim, Kaia
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- Francis, Warren R.
- Vargas, Sergio
- Kling, Svenja
- Renkert, Maike
- Polikarpov, Maxim
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- Gaspar, Imre
- Burkhardt, Pawel
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- Schneider, Thomas R.
- Kreshuk, Anna
- Worheide, Gert
- Huerta-Cepas, Jaime
- Schwab, Yannick
- Moroz, Leonid L.
- Arendt, Detlev;
Science (p. 717-+) - 5/11/2021
10.1126/science.abj2949 View at source
- ISSN 00368075
Genetic association with high-resolution climate data reveals selection footprints in the genomes of barley landraces across the Iberian Peninsula
- Contreras-Moreira, Bruno
- Serrano-Notivoli, Roberto
- Mohammed, Naheif E.
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Begueria, Santiago
- Casas, Ana M.
- Igartua, Ernesto;
MOLECULAR ECOLOGY (p. 1994-2012) - 1/4/2019
10.1111/mec.15009 View at source
- ISSN 09621083
Harnessing Novel Diversity From Landraces to Improve an Elite Barley Variety
- Monteagudo, Arantxa
- Casas, Ana M.
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Contreras-Moreira, Bruno
- Pilar Gracia, Maria
- Igartua, Ernesto;
Frontiers In Plant Science - 1/1/2019
10.3389/fpls.2019.00434 View at source
- ISSN 1664462X
Comparative plastome genomics and phylogenomics of Brachypodium: flowering time signatures, introgression and recombination in recently diverged ecotypes
- Sancho, Ruben
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Lopez-Alvarez, Diana
- Gordon, Sean P.
- Vogel, John P.
- Catalan, Pilar
- Contreras-Moreira, Bruno;
New Phytologist (p. 1631-1644) - 1/6/2018
10.1111/nph.14926 View at source
- ISSN 0028646X
Resequencing the Vrs1 gene in Spanish barley landraces revealed reversion of six-rowed to two-rowed spike
- Casas, Ana M.
- Contreras-Moreira, Bruno
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Sakuma, Shun
- Pilar Gracia, Maria
- Moralejo, Marian
- Luis Molina-Cano, Jose
- Komatsuda, Takao
- Igartua, Ernesto;
Molecular Breeding - 1/5/2018
- ISSN 13803743
- iMarina
This researcher has no books.
Pangenome Analysis of Plant Transcripts and Coding Sequences
- Contreras-Moreira B
- del Río ÁR
- Cantalapiedra CP
- Sancho R
- Vinuesa P
Methods In Molecular Biology (p. 121-152) - 1/1/2022
10.1007/978-1-0716-2429-6_9 View at source
- ISSN 10643745
Genome-wide association studies (GWAS) in barley
- Igartua, Ernesto
- Cantalapiedra, Carlos P.
- Casas, Ana M.;
Water Management For Sustainable Agriculture (p. 503-535) - 1/1/2019
10.19103/as.2019.0051.24 View at source
- ISSN 20596936
RSAT::Plants: Motif Discovery Within Clusters of Upstream Sequences in Plant Genomes
- Contreras-Moreira, Bruno
- Castro-Mondragon, Jaime A.
- Rioualen, Claire
- Cantalapiedra, Carlos P.
- van Helden, Jacques;
Methods In Molecular Biology (p. 279-295) - 1/1/2016
10.1007/978-1-4939-6396-6_18 View at source
- ISSN 10643745
Interface similarity improves comparison of DNA-binding proteins: The Homeobox example
- Sebastián A
- Cantalapiedra C
- Contreras-Moreira B
Lecture Notes In Computer Science (p. 72-82) - 9/4/2012
10.1007/978-3-642-28062-7_8 View at source
- ISSN 03029743
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RESUME THE SEARCH OF THE FUNGUS SPECIES IN SAMPLES FROM USA, PROYECTO ABIERTO
- HUERTA CEPAS, JAIME (Colaborador/a)
- PEREZ CANTALAPIEDRA, CARLOS (Investigador principal (IP))
Period: 09-01-2024 - 08-07-2024
Type of funding: Internal
- iMarina
SEARCH IN FUNGAL DATABASES USING A PRE ASSEMBLED AND ANNOTATED REFERENCED GENOME
- HUERTA CEPAS, JAIME (Colaborador/a)
- PEREZ CANTALAPIEDRA, CARLOS (Investigador principal (IP))
Period: 08-06-2023 - 08-12-2023
Type of funding: Internal
- iMarina
Acreditación Centros de Excelencia Severo Ochoa
- PAGAN MUÑOZ, JESUS ISRAEL (Miembro del equipo de trabajo)
- POLLMANN, STEPHAN (Miembro del equipo de trabajo)
- GARRIDO ARANDIA, MARIA (Miembro del equipo de trabajo)
- MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL (Miembro del equipo de trabajo)
- GONZALEZ GUERRERO, MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- SÁNCHEZ VALLET, ANDREA (Miembro del equipo de trabajo)
- ECHAVARRI ERASUN, CARLOS (Miembro del equipo de trabajo)
- JORDA MIRO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
- DUNGER, RICARDO GERMAN (Miembro del equipo de trabajo)
- LOPEZ SOLANILLA, EMILIA ANTONIA (Miembro del equipo de trabajo)
- DE FRANCESCO, AGUSTINA (Miembro del equipo de trabajo)
- MEDINA ALCAZAR, JOAQUIN (Miembro del equipo de trabajo)
- FORTUNY CECCONI, AGUSTINA PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
- SANTAMARIA FERNANDEZ, MARIA ESTRELLA (Miembro del equipo de trabajo)
- TOME AMAT, JAIME MARIA (Miembro del equipo de trabajo)
- PERALES, MARIANO MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- RICO MOLINS, JUAN (Miembro del equipo de trabajo)
- TOMAZ SANTOS BOTELHO, JOAO FRANCISCO (Miembro del equipo de trabajo)
- PEREZ CANTALAPIEDRA, CARLOS (Miembro del equipo de trabajo)
- WILKINSON, MARK DENIS (Miembro del equipo de trabajo)
- Toribio Lopez, Francisco Rene (Miembro del equipo de trabajo)
- IGLESIAS FERNANDEZ, RAQUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- SANTAMARIA HERNANDO, SARAY (Miembro del equipo de trabajo)
- RUBIO HERRERO, LUIS MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- RAHO HOURCADES, NICOLAS (Miembro del equipo de trabajo)
- IMPERIAL RÓDENAS, JUAN (Miembro del equipo de trabajo)
- CARRASCO LOPEZ, PETERSON CRISTIAN (Miembro del equipo de trabajo)
- ARMAS ALVAREZ, ALEJANDRO MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- SEYLLER ALVARADO, AARON (Miembro del equipo de trabajo)
- DEL POZO BENITO, JUAN CARLOS (Miembro del equipo de trabajo)
- Wabnik, Anna Barbara (Miembro del equipo de trabajo)
- Castellano Moreno, Mar (Miembro del equipo de trabajo)
- MOLINA FERNANDEZ, ANTONIO (Miembro del equipo de trabajo)
- Diaz Perales, Araceli (Miembro del equipo de trabajo)
- WABNIK, KRZYSZTOF (Miembro del equipo de trabajo)
- COUCE IGLESIAS, ALEJANDRO (Miembro del equipo de trabajo)
- ABELENDA VILA, JOSE ANTONIO (Miembro del equipo de trabajo)
- CARO BERNAT, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- CUTUGNO, LAURA (Miembro del equipo de trabajo)
- PONZ ASCASO, FERNANDO (Miembro del equipo de trabajo)
- Perez Alonso, Marta Marina (Miembro del equipo de trabajo)
- LOPEZ GARCIA, ADRIAN (Miembro del equipo de trabajo)
- HOANG VAN, CUONG (Miembro del equipo de trabajo)
- VICENTE CARBAJOSA, JESUS (Miembro del equipo de trabajo)
- MONTOLIU NERIN, MERCE (Miembro del equipo de trabajo)
- SACRISTAN BENAYAS, SOLEDAD (Miembro del equipo de trabajo)
- PATEL, MANISH KUMAR (Miembro del equipo de trabajo)
- PALACIOS ALBERTI, JOSE MANUEL (Miembro del equipo de trabajo)
- DE, AISHEE (Miembro del equipo de trabajo)
Period: 01-01-2022 - 31-12-2025
Type of funding: National
- iMarina
This researcher has no supervised thesis.
This researcher has no patents or software licenses.
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