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Perfil en el portal institucional

Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es

INTELIGENCIA ARTIFICIAL / Universidad Politécnica de Madrid

Actividades

Biomolecular Computers

  • Sainz de Murieta, Inaki
  • Miro-Bueno, Jesus M.
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Current Bioinformatics (p. 173-184) - 1/6/2011

  • ISSN 15748936
  • iMarina

Computational methods for identifying the critical nodes in biological networks

  • Liu X
  • Hong Z
  • Liu J
  • Lin Y
  • Rodríguez-Patón A
  • Zou Q
  • Zeng X
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Briefings In Bioinformatics (p. 486-497) - 23/3/2020

10.1093/bib/bbz011 Ver en origen

  • ISSN 14675463

AMDE: a novel attention-mechanism-based multidimensional feature encoder for drug-drug interaction prediction

  • Pang S
  • Zhang Y
  • Song T
  • Zhang X
  • Wang X
  • Rodriguez-Patón A

Briefings In Bioinformatics - 1/1/2022

10.1093/bib/bbab545 Ver en origen

  • ISSN 14675463

Molormer: a lightweight self-attention-based method focused on spatial structure of molecular graph for drug-drug interactions prediction

  • Zhang X
  • Wang G
  • Meng X
  • Wang S
  • Zhang Y
  • Rodriguez-Paton A
  • Wang J
  • Wang X
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Briefings In Bioinformatics - 19/7/2022

10.1093/bib/bbac296 Ver en origen

  • ISSN 14675463

Probability-based collaborative filtering model for predicting gene-disease associations

  • Zeng, Xiangxiang
  • Ding, Ningxiang
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Zou, Quan;

Bmc Medical Genomics - 28/12/2017

10.1186/s12920-017-0313-y Ver en origen

  • ISSN 17558794

A P system and a constructive membrane-inspired DNA algorithm for solving the Maximum Clique Problem

  • Garcia-Arnau, Marc
  • Manrique, Daniel
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Sosik, Petr

Biosystems (p. 687-697) - 1/11/2007

10.1016/j.biosystems.2007.02.005 Ver en origen

  • ISSN 03032647

DNA strand displacement system running logic programs

  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Sainz de Murieta, Inaki
  • Sosik, Petr;

Biosystems (p. 5-12) - 1/1/2014

10.1016/j.biosystems.2013.10.006 Ver en origen

  • ISSN 03032647

DNA biosensors that reason

  • Sainz de Murieta, Inaki
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Biosystems (p. 91-104) - 1/8/2012

10.1016/j.biosystems.2012.02.005 Ver en origen

  • ISSN 03032647

Multi-TransDTI: Transformer for Drug–Target Interaction Prediction Based on Simple Universal Dictionaries with Multi-View Strategy

  • Wang G
  • Zhang X
  • Pan Z
  • Patón AR
  • Wang S
  • Song T
  • Gu Y
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Biomolecules - 1/1/2022

10.3390/biom12050644 Ver en origen

  • ISSN 2218273X

CSConv2d: A 2-D Structural Convolution Neural Network with a Channel and Spatial Attention Mechanism for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction

  • Wang, Xun
  • Liu, Dayan
  • Zhu, Jinfu
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Song, Tao;

Biomolecules - 1/5/2021

10.3390/biom11050643 Ver en origen

  • ISSN 2218273X

Este/a investigador/a no tiene libros.

An implementation of elementary arithmetic with virus machine

  • Xiaoshan Yan
  • Xiangrong Liu
  • Xiangxiang Zeng
  • Alfonso Rodríquez Patón

Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018

10.1007/978-3-030-00265-7_24 Ver en origen

  • ISSN 03029743

On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík
  • Ludek Cienciala

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010

  • iMarina

Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes

  • Petr Sosík
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Lucie Ciencialová

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010

  • iMarina

Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques

  • Manrique D
  • Ríos J
  • Rodríguez-Patón A

Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005

10.4018/978-1-59140-902-1.ch005 Ver en origen

Biomolecular computing devices in synthetic biology

  • Miró J
  • Rodríguez-Patón A

Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008

10.4018/978-1-59904-996-0.ch014 Ver en origen

Normal forms for spiking neural P systems

  • Óscar H Ibarra
  • Andrei Paun
  • Gheorge Paun
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík
  • Sara Woodworth

Theoretical Computer Science (p. 196-217) - 15/3/2007

10.1016/j.tcs.2006.11.025 Ver en origen

  • ISSN 03043975

Tissue P systems

  • Martín-Vide C
  • Pǎun G
  • Pazos J
  • Rodríguez-Patón A

Theoretical Computer Science (p. 295-326) - 8/3/2003

10.1016/s0304-3975(02)00659-x Ver en origen

  • ISSN 03043975

Computing with membranes: P systems with Worm-Objects

  • Castellanos, J
  • Paun, G
  • Rodriguez-Paton, A;

Spire 2000: Seventh International Symposium On String Processing And Information Retrieval - Proceedings (p. 65-74) - 1/1/2000

10.1109/spire.2000.878181 Ver en origen

CONTEXT MEASURE IN QUALITATIVE REASONING

  • GOMEZPEREZ, A
  • JURISTO, N
  • PAZOS, J
  • PATON, AR;

Qualitative Reasoning And Decision Technologies (p. 605-612) - 1/1/1993

  • iMarina

Spiking Neural P Systems with Several Types of Spikes

  • Mihai Ionescu
  • Gheorge Paun
  • Mario de Jesús Pérez Jiménez
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas

Proceedings Of The Ninth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 183-192) - 31/1/2011

10.15837/ijccc.2011.4.2092 Ver en origen

  • ISSN 18419836

Designing radial basis function networks with genetic algorithms

  • Camacho, F
  • Manrique, D
  • Rodriguez-Paton, A;

Proceedings Of The Eighth Iasted International Conference On Artificial Intelligence And Soft Computing (p. 398-403) - 1/1/2004

  • iMarina

Self-consciousness for artificial entities using Modular Neural Networks

  • Martinez Luaces, Milton
  • Gayoso Rocha, Celina
  • Pazos Sierra, Juan
  • Rodriguez Paton, Alfonso;

Proceedings Of The 9th Wseas International Conference On Neural Networks (Nn' 08) (p. 113-118) - 1/1/2008

  • iMarina

BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences

  • Jesus Irimia
  • Gupta, Vishal
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016

  • iMarina

LncRNA-disease association prediction based on neighborhood information aggregation in neural network

  • Chen H
  • Wang X
  • Zhang X
  • Zeng X
  • Song T
  • Rodriguez-Paton A

Proceedings - 2018 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2018 (p. 175-178) - 21/1/2019

10.1109/bibm.2018.8621441 Ver en origen

  • ISSN 21561133

Iteratively collective prediction of disease-gene associations through the incomplete network

  • Meng, Xiangyi
  • Zou, Quan
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Zeng, Xiangxiang;

Proceedings - 2017 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2017 (p. 1324-1330) - 15/12/2017

10.1109/bibm.2017.8217854 Ver en origen

Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.

Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.

Ultrasensitive BIOsensing platform for multiplex CELLular protein PHEnotyping at single-cell level

  • LEON PRIETO, LUCIA (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
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Ejecución: 01-04-2021 - 31-03-2025

Tipo: Internacional

Importe financiado: 303250,00 Euros.

  • iMarina

Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • Mitrana, Victor (Participante)
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Ejecución: 01-06-2020 - 31-05-2023

Tipo: Nacional

Importe financiado: 87120,00 Euros.

  • iMarina

Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
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Ejecución: 30-12-2016 - 29-12-2020

Tipo: Nacional

Importe financiado: 90387,00 Euros.

  • iMarina

General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
  • Gupta, Vishal (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
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Ejecución: 01-10-2013 - 30-09-2016

Tipo: Internacional

Importe financiado: 381795,00 Euros.

  • iMarina

Engineering multicellular biocircuits: programming cell-cell communication using plasmids as wires

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • Maojo García, Víctor Manuel (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
  • Sosik, Petr (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • GREGORIO GODOY, PAULA (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • Molina González, Martín (Participante)
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Ejecución: 01-10-2013 - 30-09-2016

Tipo: Internacional

Importe financiado: 570600,00 Euros.

  • iMarina

Programación e ingeniería de biocircuitos: diseño y modelado in silico

  • GREGORIO GODOY, PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
  • ZENG, XIANGXIANG (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • Sosik, Petr (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
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Ejecución: 01-01-2013 - 31-03-2017

Tipo: Nacional

Importe financiado: 156312,00 Euros.

  • iMarina

Modelado de procesos biológicos con sistemas P y diseño de nuevos dispositivos de cómputo biomoleculares

  • MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • Sosik, Petr (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-01-2010 - 31-07-2013

Tipo: Nacional

Importe financiado: 111078,01 Euros.

  • iMarina

Placing the T3SS effector-network paradigm within a systems level understanding of in vivo infection

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 02-05-2022 - 01-05-2027

Tipo: Internacional

  • iMarina

APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL

  • GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 06-04-2022 - 24-07-2022

Tipo: Interno

  • iMarina

PROgramable living drugs engineering MIcrobial CELLS

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-06-2019 - 31-05-2021

Tipo: Nacional

Importe financiado: 24700,00 Euros.

  • iMarina

Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos

1/1/2021

  • iMarina

Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
  • PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula

1/1/2018

  • iMarina

Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein

1/1/2017

  • iMarina

An end-to-end solution for automation of biological protocols

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal

1/1/2017

  • iMarina

Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio

1/1/2017

  • iMarina

A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo

1/1/2017

  • iMarina

Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David

1/1/2016

  • iMarina

Inference Models in DNA Computing

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes

1/1/2013

  • iMarina

Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno

1/1/2012

  • iMarina

La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: MARTINEZ LUACES, Milton

1/1/2009

  • iMarina

Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.

Última actualización de los datos: 19/03/24 0:53