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Perfil en el portal institucional

Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es

INTELIGENCIA ARTIFICIAL / Universidad Politécnica de Madrid

Actividades

A New Improved and Extended Version of the Multicell Bacterial Simulator gro

  • Gutierrez, Martin
  • Gregorio-Godoy, Paula
  • Perez del Pulgar, Guillermo
  • Munoz, Luis E.
  • Saez, Sandra
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Acs Synthetic Biology (p. 1496-1508) - 18/8/2017

10.1021/acssynbio.7b00003 Ver en origen

  • ISSN 21615063

BioBlocks: Programming Protocols in Biology Made Easier

  • Gupta, Vishal
  • Irimia, Jesus
  • Pau, Ivan
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Acs Synthetic Biology (p. 1230-1232) - 21/7/2017

10.1021/acssynbio.6b00304 Ver en origen

  • ISSN 21615063

Bolaform Surfactant-Induced Au Nanoparticle Assemblies for Reliable Solution-Based Surface-Enhanced Raman Scattering Detection

  • Garcia-Lojo, Daniel
  • Mendez-Merino, David
  • Perez-Juste, Ignacio
  • Acuna, Angel
  • Garcia-Rio, Luis
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Pastoriza-Santos, Isabel
  • Perez-Juste, Jorge;
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Advanced Materials Technologies - 1/1/2022

10.1002/admt.202101726 Ver en origen

  • ISSN 2365709X

KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions

  • Wang, Shudong
  • Du, Zhenzhen
  • Ding, Mao
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Song, Tao;

Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022

10.1007/s10489-021-02454-8 Ver en origen

  • ISSN 0924669X

An Autonomous In Vivo Dual Selection Protocol for Boolean Genetic Circuits

  • Benes, David
  • Sosik, Petr
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Artificial Life (p. 247-260) - 26/5/2015

10.1162/artl_a_00160 Ver en origen

  • ISSN 10645462

Multi-TransDTI: Transformer for Drug–Target Interaction Prediction Based on Simple Universal Dictionaries with Multi-View Strategy

  • Wang G
  • Zhang X
  • Pan Z
  • Patón AR
  • Wang S
  • Song T
  • Gu Y
... Ver más Contraer

Biomolecules - 1/1/2022

10.3390/biom12050644 Ver en origen

  • ISSN 2218273X

CSConv2d: A 2-D Structural Convolution Neural Network with a Channel and Spatial Attention Mechanism for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction

  • Wang, Xun
  • Liu, Dayan
  • Zhu, Jinfu
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Song, Tao;

Biomolecules - 1/5/2021

10.3390/biom11050643 Ver en origen

  • ISSN 2218273X

A P system and a constructive membrane-inspired DNA algorithm for solving the Maximum Clique Problem

  • Garcia-Arnau, Marc
  • Manrique, Daniel
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Sosik, Petr

Biosystems (p. 687-697) - 1/11/2007

10.1016/j.biosystems.2007.02.005 Ver en origen

  • ISSN 03032647

DNA strand displacement system running logic programs

  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Sainz de Murieta, Inaki
  • Sosik, Petr;

Biosystems (p. 5-12) - 1/1/2014

10.1016/j.biosystems.2013.10.006 Ver en origen

  • ISSN 03032647

DNA biosensors that reason

  • Sainz de Murieta, Inaki
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Biosystems (p. 91-104) - 1/8/2012

10.1016/j.biosystems.2012.02.005 Ver en origen

  • ISSN 03032647

Este/a investigador/a no tiene libros.

Biomolecular computing devices in synthetic biology

  • Miró J
  • Rodríguez-Patón A

Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008

10.4018/978-1-59904-996-0.ch014 Ver en origen

Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques

  • Manrique D
  • Ríos J
  • Rodríguez-Patón A

Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005

10.4018/978-1-59140-902-1.ch005 Ver en origen

On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík
  • Ludek Cienciala

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010

  • iMarina

Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes

  • Petr Sosík
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Lucie Ciencialová

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010

  • iMarina

An implementation of elementary arithmetic with virus machine

  • Xiaoshan Yan
  • Xiangrong Liu
  • Xiangxiang Zeng
  • Alfonso Rodríquez Patón

Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018

10.1007/978-3-030-00265-7_24 Ver en origen

  • ISSN 03029743

A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation

  • García A
  • Rodríguez-Patón A

A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015

10.1007/978-3-319-19776-0_1 Ver en origen

  • ISSN 21945357

BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation

  • Prestes Garcia, Antonio
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015

10.1007/978-3-319-18944-4_26 Ver en origen

  • ISSN 03029743

One-gene oscillators with a positive transcriptional feedback and a negative interaction

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Engeneious Conference 2012 (p. 31-31) - 25/6/2012

  • iMarina

Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator

  • Gutierrez, Martin
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Fourteenth European Conference On Artificial Life (Ecal 2017) (p. 186-187) - 1/1/2017

  • iMarina

DNA assembly and recombination for Hamiltonian paths and binary words

  • Pazos, A
  • Pazos, J
  • Paton, AR;

Gecco-99: Proceedings Of The Genetic And Evolutionary Computation Conference (p. 1822-1824) - 1/1/1999

  • iMarina

Hopcroft’s Minimization Technique: Queues or Stacks?

  • un
  • Mihaela P&#259
  • PAUN, PAUL ANDREI
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Hopcroft’S Minimization Technique: Queues Or Stacks? (p. 78-91) - 21/7/2008

10.1007/978-3-540-70844-5 Ver en origen

Biochemical Signaling: a discrete simulation with Memory Enhancement

  • Paun A
  • Paun M
  • Rodriguez-Paton A
  • Jack J

Ieee 1st International Conference On Computational Advances In Bio And Medical Sciences, Iccabs 2011, (p. 257-257) - 3/2/2011

10.1109/iccabs.2011.5729910 Ver en origen

Initialization method for grammar-guided genetic programming

  • García-Arnau M
  • Manrique D
  • Ríos J
  • Rodríguez-Patón A

Knowledge-Based Systems (p. 127-133) - 1/1/2007

10.1016/j.knosys.2006.11.006 Ver en origen

  • ISSN 09507051

Distributed computing with prokaryotic immune systems

  • Murphy N
  • Rodríguez-Patón A

Lecture Notes In Computer Science (p. 286-288) - 24/9/2012

10.1007/978-3-642-33757-4_22 Ver en origen

  • ISSN 03029743

Towards a robust biocomputing solution of intractable problems

  • Marc García-Arnau
  • Sosik, Petr
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL

Lecture Notes In Computer Science (p. 221-230) - 27/8/2008

10.1007/978-3-540-77962-9_23 Ver en origen

  • ISSN 03029743

Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.

Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.

LIA. Ingeniería microbiana, salud y calidad de vida.

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • SONG, TAO (Participante)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Participante)
  • ZENG, XIANGXIANG (Participante)

Ejecución: 01-01-2018 - 30-06-2022

Tipo: Regional

Importe financiado: 29881,60 Euros.

  • iMarina

PROGRAMMABLE BIOLOGICAL MACHINES

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-09-2017 - 31-12-2020

Tipo: Nacional

Importe financiado: 24642,00 Euros.

  • iMarina

EVOlutionary PROgrammable antiBIOTICS

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-03-2014 - 28-02-2017

Tipo: Nacional

Importe financiado: 20862,00 Euros.

  • iMarina

BACTOCOM: Bacterial Computing with Engineered Populations.

  • MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • Sosik, Petr (Participante)
  • GOMEZ ESTEBAN, PABLO (Participante)

Ejecución: 01-02-2010 - 31-07-2013

Tipo: Internacional

Importe financiado: 240918,00 Euros.

  • iMarina

Desarrollo de aplicaciones de la computación celular con membranas y la computación biomolecular en la biología

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-10-2006 - 31-12-2009

Tipo: Nacional

  • iMarina

Descifrando las infecciones bacterianas con técnicas de inteligencia artificial e ingeniería de biocircuitos

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • Mitrana, Victor (Participante)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • LEON PRIETO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
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Ejecución: 01-09-2023 - 31-08-2026

Tipo: Nacional

  • iMarina

Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos

1/1/2021

  • iMarina

Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
  • PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula

1/1/2018

  • iMarina

Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein

1/1/2017

  • iMarina

An end-to-end solution for automation of biological protocols

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal

1/1/2017

  • iMarina

Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio

1/1/2017

  • iMarina

A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo

1/1/2017

  • iMarina

Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David

1/1/2016

  • iMarina

Inference Models in DNA Computing

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes

1/1/2013

  • iMarina

Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno

1/1/2012

  • iMarina

La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: MARTINEZ LUACES, Milton

1/1/2009

  • iMarina

Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.

Última actualización de los datos: 19/03/24 0:53