Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es
Actividades
- Artículos 75
- Libros 0
- Capítulos de libro 5
- Congresos 39
- Documentos de trabajo 0
- Informes técnicos 0
- Proyectos de investigación 16
- Tesis dirigidas 12
- Patentes o licencias de software 0
DNMG: Deep molecular generative model by fusion of 3D information for de novo drug design
Methods (p. 10-22) - 1/3/2023
10.1016/j.ymeth.2023.02.001 Ver en origen
- ISSN 10462023
BioBlocksLab: A portable DIY Bio Lab using BioBlocks language
- Ma, TM
- Méndez-Merino, D
- Uría-Regojo, G
- Sánchez-Fernández, C
- Giner-Sánchez, L
- Guerrero-Aspizua, S
- Quílez-López, C
- Rodríguez-Patón, A
Methods (p. 36-43) - 1/2/2023
10.1016/j.ymeth.2023.01.001 Ver en origen
- ISSN 10462023
Will data analytics revolution finally bring SERS to the clinic?
- Mahmoud, AYF
- Teixeira, A
- Aranda, M
- Relvas, MS
- Quintero, S
- Sousa-Silva, M
- Chícharo, A
- Chen, MK
- Hashemi, M
- King, JB
- Tunnell, JW
- Morasso, C
- Piccotti, F
- Corsi, F
- Henriksen-Lacey, M
- Aberasturi, DJD
- Méndez-Merino, D
- Rodríguez-Patón, A
- Abalde-Cela, S
- Diéguez, L
Trac-Trends In Analytical Chemistry - 1/12/2023
10.1016/j.trac.2023.117311 Ver en origen
- ISSN 01659936
PETrans: De Novo Drug Design with Protein-Specific Encoding Based on Transfer Learning
International Journal Of Molecular Sciences - 1/1/2023
10.3390/ijms24021146 Ver en origen
- ISSN 14220067
Molormer: a lightweight self-attention-based method focused on spatial structure of molecular graph for drug-drug interactions prediction
Briefings In Bioinformatics - 19/7/2022
10.1093/bib/bbac296 Ver en origen
- ISSN 14675463
KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions
- Wang, Shudong
- Du, Zhenzhen
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao;
Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022
10.1007/s10489-021-02454-8 Ver en origen
- ISSN 0924669X
Network-Based Approaches for Drug Repositioning
- Song, T
- Wang, G
- Ding, M
- Rodriguez-Paton, A
- Wang, X
- Wang, SD
Molecular Informatics - 1/1/2022
10.1002/minf.202100200 Ver en origen
- ISSN 18681743
AMDE: a novel attention-mechanism-based multidimensional feature encoder for drug-drug interaction prediction
- Pang S
- Zhang Y
- Song T
- Zhang X
- Wang X
- Rodriguez-Patón A
Briefings In Bioinformatics - 1/1/2022
10.1093/bib/bbab545 Ver en origen
- ISSN 14675463
DeepFusion: A deep learning based multi-scale feature fusion method for predicting drug-target interactions
- Song T
- Zhang X
- Ding M
- Rodriguez-Paton A
- Wang S
- Wang G
Methods (p. 269-277) - 1/1/2022
10.1016/j.ymeth.2022.02.007 Ver en origen
- ISSN 10462023
Bolaform Surfactant-Induced Au Nanoparticle Assemblies for Reliable Solution-Based Surface-Enhanced Raman Scattering Detection
- Garcia-Lojo, Daniel
- Mendez-Merino, David
- Perez-Juste, Ignacio
- Acuna, Angel
- Garcia-Rio, Luis
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Pastoriza-Santos, Isabel
- Perez-Juste, Jorge;
Advanced Materials Technologies - 1/1/2022
10.1002/admt.202101726 Ver en origen
- ISSN 2365709X
Este/a investigador/a no tiene libros.
An implementation of elementary arithmetic with virus machine
- Xiaoshan Yan
- Xiangrong Liu
- Xiangxiang Zeng
- Alfonso Rodríquez Patón
Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018
10.1007/978-3-030-00265-7_24 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Petr Sosík
- Ludek Cienciala
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010
- iMarina
Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes
- Petr Sosík
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Lucie Ciencialová
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010
- iMarina
Biomolecular computing devices in synthetic biology
- Miró J
- Rodríguez-Patón A
Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008
Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques
- Manrique D
- Ríos J
- Rodríguez-Patón A
Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005
LncRNA-disease association prediction based on neighborhood information aggregation in neural network
- Chen H
- Wang X
- Zhang X
- Zeng X
- Song T
- Rodriguez-Paton A
Proceedings - 2018 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2018 (p. 175-178) - 21/1/2019
10.1109/bibm.2018.8621441 Ver en origen
- ISSN 21561133
- iMarina
- iMarina
An auxin hormone - signaling factors oscillator regulates time-dependent branching in the Arabidopsis root
- Marcos Rodriguez
- Juan Perianez-Rodriguez
- Juan Carlos del Pozo
- Angela Saez
- SANCHEZ CORRIONERO, ALVARO
- BUSTILLO AVENDAÑO, ESTEFANO
- MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Libro De Resumenes Del Xv Simposio De Fitohormonas De La Sociedad Española De Fisiología Vegetal (p. 28-28) - 13/12/2018
- iMarina
Iteratively collective prediction of disease-gene associations through the incomplete network
- Meng, Xiangyi
- Zou, Quan
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Zeng, Xiangxiang;
Proceedings - 2017 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2017 (p. 1324-1330) - 15/12/2017
10.1109/bibm.2017.8217854 Ver en origen
- iMarina
- iMarina
Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator
- Gutierrez, Martin
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Fourteenth European Conference On Artificial Life (Ecal 2017) (p. 186-187) - 1/1/2017
- iMarina
BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences
- Jesus Irimia
- Gupta, Vishal
- PAU DE LA CRUZ, IVAN
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016
- iMarina
BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation
- Prestes Garcia, Antonio
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015
10.1007/978-3-319-18944-4_26 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation
- García A
- Rodríguez-Patón A
A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015
10.1007/978-3-319-19776-0_1 Ver en origen
- ISSN 21945357
- iMarina
- iMarina
Probabilistic reasoning with an enzyme-driven DNA device
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Lecture Notes In Computer Science (p. 160-173) - 2/12/2013
10.1007/978-3-319-01928-4_12 Ver en origen
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
Distributed computing with prokaryotic immune systems
- Murphy N
- Rodríguez-Patón A
Lecture Notes In Computer Science (p. 286-288) - 24/9/2012
10.1007/978-3-642-33757-4_22 Ver en origen
- ISSN 03029743
Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.
Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.
Engineering multicellular biocircuits: programming cell-cell communication using plasmids as wires
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Maojo García, Víctor Manuel (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- GREGORIO GODOY, PAULA (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- Molina González, Martín (Participante)
Ejecución: 01-10-2013 - 30-09-2016
Tipo: Internacional
Importe financiado: 570600,00 Euros.
- iMarina
General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
- Gupta, Vishal (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Ejecución: 01-10-2013 - 30-09-2016
Tipo: Internacional
Importe financiado: 381795,00 Euros.
- iMarina
Programación e ingeniería de biocircuitos: diseño y modelado in silico
- GREGORIO GODOY, PAULA (Miembro del equipo de trabajo)
- ZENG, XIANGXIANG (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-01-2013 - 31-03-2017
Tipo: Nacional
Importe financiado: 156312,00 Euros.
- iMarina
BACTOCOM: Bacterial Computing with Engineered Populations.
- MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- Sosik, Petr (Participante)
- GOMEZ ESTEBAN, PABLO (Participante)
Ejecución: 01-02-2010 - 31-07-2013
Tipo: Internacional
Importe financiado: 240918,00 Euros.
- iMarina
Modelado de procesos biológicos con sistemas P y diseño de nuevos dispositivos de cómputo biomoleculares
- MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-01-2010 - 31-07-2013
Tipo: Nacional
Importe financiado: 111078,01 Euros.
- iMarina
Desarrollo de aplicaciones de la computación celular con membranas y la computación biomolecular en la biología
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Ejecución: 01-10-2006 - 31-12-2009
Tipo: Nacional
- iMarina
Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos
1/1/2021
- iMarina
Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
- PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula
1/1/2018
- iMarina
Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein
1/1/2017
- iMarina
An end-to-end solution for automation of biological protocols
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal
1/1/2017
- iMarina
Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio
1/1/2017
- iMarina
A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo
1/1/2017
- iMarina
Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David
1/1/2016
- iMarina
Inference Models in DNA Computing
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes
1/1/2013
- iMarina
Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno
1/1/2012
- iMarina
Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.
Grupos de investigación
-
Grupo de Inteligencia Artificial (LIA)
Rol: Investigador Principal
Perfiles de investigador/a
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