Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es

Actividades

Multi-TransDTI: Transformer for Drug–Target Interaction Prediction Based on Simple Universal Dictionaries with Multi-View Strategy

  • Wang G
  • Zhang X
  • Pan Z
  • Patón AR
  • Wang S
  • Song T
  • Gu Y
... Ver más Contraer

Biomolecules - 1/1/2022

10.3390/biom12050644 Ver en origen

  • ISSN 2218273X

CSConv2d: A 2-D Structural Convolution Neural Network with a Channel and Spatial Attention Mechanism for Protein-Ligand Binding Affinity Prediction

  • Wang, Xun
  • Liu, Dayan
  • Zhu, Jinfu
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Song, Tao;

Biomolecules - 1/5/2021

10.3390/biom11050643 Ver en origen

  • ISSN 2218273X

Monodirectional tissue P systems with channel states

  • Song B
  • Zeng X
  • Rodríguez-Patón A

Information Sciences (p. 206-219) - 1/1/2021

10.1016/j.ins.2020.08.030 Ver en origen

  • ISSN 00200255

An auxin-regulable oscillatory circuit drives the root clock in arabidopsis

  • Perianez-Rodriguez J
  • Rodriguez M
  • Marconi M
  • Bustillo-Avendaño E
  • Wachsman G
  • Sanchez-Corrionero A
  • de Gernier H
  • Cabrera J
  • Perez-Garcia P
  • Gude I
  • Saez A
  • Serrano-Ron L
  • Beeckman T
  • Benfey PN
  • Rodríguez-Patón A
  • del Pozo JC
  • Wabnik K
  • Moreno-Risueno MA
... Ver más Contraer

Science Advances - 1/1/2021

10.1126/sciadv.abd4722 Ver en origen

  • ISSN 23752548

DNA-Guided Assembly for Fibril Proteins

  • Amarioarei, Alexandru
  • Spencer, Frankie
  • Barad, Gefry
  • Gheorghe, Ana-Maria
  • Itcus, Corina
  • Tusa, Iris
  • Prelipcean, Ana-Maria
  • Paun, Andrei
  • Paun, Mihaela
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Trandafir, Romica
  • Czeizler, Eugen;
... Ver más Contraer

Mathematics (p. 404-17) - 1/1/2021

10.3390/math9040404 Ver en origen

  • ISSN 22277390

Type III secretion system effectors form robust and flexible intracellular virulence networks

  • Ruano-Gallego D
  • Sanchez-Garrido J
  • Kozik Z
  • Núñez-Berrueco E
  • Cepeda-Molero M
  • Mullineaux-Sanders C
  • Clark JNB
  • Slater SL
  • Wagner N
  • Glegola-Madejska I
  • Roumeliotis TI
  • Pupko T
  • Fernández LÁ
  • Rodríguez-Patón A
  • Choudhary JS
  • Frankel G
... Ver más Contraer

Science (p. 1122-+) - 1/1/2021

10.1126/science.abc9531 Ver en origen

  • ISSN 00368075

Neural-like P systems with plasmids

  • Cabarle, Francis George C.
  • Zeng, Xiangxiang
  • Murphy, Niall
  • Song, Tao
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Liu, Xiangrong;

Information And Computation - 1/1/2021

10.1016/j.ic.2021.104766 Ver en origen

  • ISSN 08905401

Computational methods for identifying the critical nodes in biological networks

  • Liu X
  • Hong Z
  • Liu J
  • Lin Y
  • Rodríguez-Patón A
  • Zou Q
  • Zeng X
... Ver más Contraer

Briefings In Bioinformatics (p. 486-497) - 23/3/2020

10.1093/bib/bbz011 Ver en origen

  • ISSN 14675463

Deep Collaborative Filtering for Prediction of Disease Genes

  • Zeng, Xiangxiang
  • Lin, Yinglai
  • He, Yuying
  • Lu, Linyuan
  • Min, Xiaoping
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Ieee-Acm Transactions On Computational Biology And Bioinformatics (p. 1639-1647) - 1/1/2020

10.1109/tcbb.2019.2907536 Ver en origen

  • ISSN 15455963

An artificial intelligent diagnostic system on mobile Android terminals for cholelithiasis by lightweight convolutional neural network

  • Pang S
  • Wang S
  • Rodriguez-Paton A
  • Li P
  • Wang X

Plos One - 1/9/2019

10.1371/journal.pone.0221720 Ver en origen

Este/a investigador/a no tiene libros.

An implementation of elementary arithmetic with virus machine

  • Xiaoshan Yan
  • Xiangrong Liu
  • Xiangxiang Zeng
  • Alfonso Rodríquez Patón

Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018

10.1007/978-3-030-00265-7_24 Ver en origen

  • ISSN 03029743

On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Petr Sosík
  • Ludek Cienciala

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010

  • iMarina

Standardized Proofs of PSPACE-completeness of P Systems with Active Membranes

  • Petr Sosík
  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
  • Lucie Ciencialová

Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 301-310) - 1/1/2010

  • iMarina

Biomolecular computing devices in synthetic biology

  • Miró J
  • Rodríguez-Patón A

Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008

10.4018/978-1-59904-996-0.ch014 Ver en origen

Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques

  • Manrique D
  • Ríos J
  • Rodríguez-Patón A

Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005

10.4018/978-1-59140-902-1.ch005 Ver en origen

LncRNA-disease association prediction based on neighborhood information aggregation in neural network

  • Chen H
  • Wang X
  • Zhang X
  • Zeng X
  • Song T
  • Rodriguez-Paton A

Proceedings - 2018 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2018 (p. 175-178) - 21/1/2019

10.1109/bibm.2018.8621441 Ver en origen

  • ISSN 21561133

An auxin hormone - signaling factors oscillator regulates time-dependent branching in the Arabidopsis root

  • Marcos Rodriguez
  • Juan Perianez-Rodriguez
  • Juan Carlos del Pozo
  • Angela Saez
  • SANCHEZ CORRIONERO, ALVARO
  • BUSTILLO AVENDAÑO, ESTEFANO
  • MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
... Ver más Contraer

Libro De Resumenes Del Xv Simposio De Fitohormonas De La Sociedad Española De Fisiología Vegetal (p. 28-28) - 13/12/2018

  • iMarina

Iteratively collective prediction of disease-gene associations through the incomplete network

  • Meng, Xiangyi
  • Zou, Quan
  • Rodriguez-Paton, Alfonso
  • Zeng, Xiangxiang;

Proceedings - 2017 Ieee International Conference On Bioinformatics And Biomedicine, Bibm 2017 (p. 1324-1330) - 15/12/2017

10.1109/bibm.2017.8217854 Ver en origen

Simulating multicell populations with an accelerated gro simulator

  • Gutierrez, Martin
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Fourteenth European Conference On Artificial Life (Ecal 2017) (p. 186-187) - 1/1/2017

  • iMarina

BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences

  • Jesus Irimia
  • Gupta, Vishal
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016

  • iMarina

BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation

  • Prestes Garcia, Antonio
  • Rodriguez-Paton, Alfonso;

Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015

10.1007/978-3-319-18944-4_26 Ver en origen

  • ISSN 03029743

A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation

  • García A
  • Rodríguez-Patón A

A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015

10.1007/978-3-319-19776-0_1 Ver en origen

  • ISSN 21945357

Probabilistic reasoning with an enzyme-driven DNA device

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Lecture Notes In Computer Science (p. 160-173) - 2/12/2013

10.1007/978-3-319-01928-4_12 Ver en origen

  • ISSN 03029743

Distributed computing with prokaryotic immune systems

  • Murphy N
  • Rodríguez-Patón A

Lecture Notes In Computer Science (p. 286-288) - 24/9/2012

10.1007/978-3-642-33757-4_22 Ver en origen

  • ISSN 03029743

One-gene oscillators with a positive transcriptional feedback and a negative interaction

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE

Engeneious Conference 2012 (p. 31-31) - 25/6/2012

  • iMarina

Este/a investigador/a no tiene documentos de trabajo.

Este/a investigador/a no tiene informes técnicos.

Descifrando las infecciones bacterianas con técnicas de inteligencia artificial e ingeniería de biocircuitos

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • Mitrana, Victor (Participante)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • LEON PRIETO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
... Ver más Contraer

Ejecución: 01-09-2023 - 31-08-2026

Tipo: Nacional

  • iMarina

Placing the T3SS effector-network paradigm within a systems level understanding of in vivo infection

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 02-05-2022 - 01-05-2027

Tipo: Internacional

  • iMarina

APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL

  • GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 06-04-2022 - 24-07-2022

Tipo: Interno

  • iMarina

Ultrasensitive BIOsensing platform for multiplex CELLular protein PHEnotyping at single-cell level

  • LEON PRIETO, LUCIA (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
... Ver más Contraer

Ejecución: 01-04-2021 - 31-03-2025

Tipo: Internacional

Importe financiado: 303250,00 Euros.

  • iMarina

Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes

  • LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • SONG, TAO (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • Fuertes Castro, José Luis (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • Mitrana, Victor (Participante)
... Ver más Contraer

Ejecución: 01-06-2020 - 31-05-2023

Tipo: Nacional

Importe financiado: 87120,00 Euros.

  • iMarina

PROgramable living drugs engineering MIcrobial CELLS

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-06-2019 - 31-05-2021

Tipo: Nacional

Importe financiado: 24700,00 Euros.

  • iMarina

LIA. Ingeniería microbiana, salud y calidad de vida.

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • SONG, TAO (Participante)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Participante)
  • NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Participante)
  • ZENG, XIANGXIANG (Participante)

Ejecución: 01-01-2018 - 30-06-2022

Tipo: Regional

Importe financiado: 29881,60 Euros.

  • iMarina

PROGRAMMABLE BIOLOGICAL MACHINES

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-09-2017 - 31-12-2020

Tipo: Nacional

Importe financiado: 24642,00 Euros.

  • iMarina

Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial

  • MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
  • HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
  • MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
  • MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
  • PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
  • BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
  • GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
  • PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
... Ver más Contraer

Ejecución: 30-12-2016 - 29-12-2020

Tipo: Nacional

Importe financiado: 90387,00 Euros.

  • iMarina

EVOlutionary PROgrammable antiBIOTICS

  • RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))

Ejecución: 01-03-2014 - 28-02-2017

Tipo: Nacional

Importe financiado: 20862,00 Euros.

  • iMarina

Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos

1/1/2021

  • iMarina

Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
  • PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula

1/1/2018

  • iMarina

Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein

1/1/2017

  • iMarina

An end-to-end solution for automation of biological protocols

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal

1/1/2017

  • iMarina

Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio

1/1/2017

  • iMarina

A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo

1/1/2017

  • iMarina

Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David

1/1/2016

  • iMarina

Inference Models in DNA Computing

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes

1/1/2013

  • iMarina

Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models

  • Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Jesús María Miró Bueno

1/1/2012

  • iMarina

La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares

  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: MARTINEZ LUACES, Milton

1/1/2009

  • iMarina

Este/a investigador/a no tiene patentes o licencias de software.

Última actualización de los datos: 19/03/24 0:53