Rodriguez-paton Aradas, Alfonso Vicente alfonso.rodriguez-paton@upm.es
Publications
- Articles 75
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- Research projects 16
- Supervised theses 12
- Patent or software license 0
Deep Collaborative Filtering for Prediction of Disease Genes
- Zeng, Xiangxiang
- Lin, Yinglai
- He, Yuying
- Lu, Linyuan
- Min, Xiaoping
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Ieee-Acm Transactions On Computational Biology And Bioinformatics (p. 1639-1647) - 1/1/2020
10.1109/tcbb.2019.2907536 View at source
- ISSN 15455963
DeepFusion: A deep learning based multi-scale feature fusion method for predicting drug-target interactions
- Song T
- Zhang X
- Ding M
- Rodriguez-Paton A
- Wang S
- Wang G
Methods (p. 269-277) - 1/1/2022
10.1016/j.ymeth.2022.02.007 View at source
- ISSN 10462023
Directed evolution of biocircuits using conjugative plasmids and CRISPR-Cas9: design and in silico experiments
- Benes, David
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Sosik, Petr;
Natural Computing (p. 497-505) - 1/9/2017
10.1007/s11047-016-9595-9 View at source
- ISSN 15677818
Double Layers Self-Organized Spiking Neural P Systems With Anti-Spikes for Fingerprint Recognition
- Ma, Tongmao
- Hao, Shaohua
- Wang, Xun
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Wang, Shudong
- Song, Tao
Ieee Access (p. 177562-177570) - 1/1/2019
10.1109/access.2019.2958895 View at source
- ISSN 21693536
Dynamical Task Switching in Cellular Computers
- Goni-Moreno, Angel
- de la Cruz, Fernando
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Amos, Martyn;
Life - 26/1/2019
10.3390/life9010014 View at source
- ISSN 20751729
Engineered toxin–intein antimicrobials can selectively target and kill antibiotic-resistant bacteria in mixed populations
- López-Igual R
- Bernal-Bayard J
- Rodríguez-Patón A
- Ghigo J
- Mazel D
Nature Biotechnology (p. 755-+) - 1/7/2019
10.1038/s41587-019-0105-3 View at source
- ISSN 10870156
Evolutionary system for automatically constructing and adapting radial basis function networks
- Manrique, Daniel
- Rios, Juan
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Neurocomputing (p. 2268-2283) - 1/1/2006
10.1016/j.neucom.2005.06.018 View at source
- ISSN 09252312
Grammar based crossover operator in genetic programming
- Manrique, D
- Marquez, F
- Rios, J
- Rodriguez-Paton, A;
Lecture Notes In Computer Science (p. 252-261) - 1/1/2005
10.1007/11499305_26 View at source
- ISSN 03029743
Highly Biocompatible Drug-Delivery Systems Based on DNA Nanotechnology
- Li, Xin
- Hong, Li
- Song, Tao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Chen, Congzhou
- Zhao, Haiyan
- Shi, Xiaolong;
Journal Of Biomedical Nanotechnology (p. 747-757) - 1/7/2017
10.1166/jbn.2017.2383 View at source
- ISSN 15507033
KG-DTI: a knowledge graph based deep learning method for drug-target interaction predictions and Alzheimer's disease drug repositions
- Wang, Shudong
- Du, Zhenzhen
- Ding, Mao
- Rodriguez-Paton, Alfonso
- Song, Tao;
Applied Intelligence (p. 846-857) - 1/1/2022
10.1007/s10489-021-02454-8 View at source
- ISSN 0924669X
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An implementation of elementary arithmetic with virus machine
- Xiaoshan Yan
- Xiangrong Liu
- Xiangxiang Zeng
- Alfonso Rodríquez Patón
Lecture Notes In Computer Science (p. 304-317) - 1/1/2018
10.1007/978-3-030-00265-7_24 View at source
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
Biomolecular computing devices in synthetic biology
- Miró J
- Rodríguez-Patón A
Advancing Artificial Intelligence Through Biological Process Applications (p. 250-267) - 1/12/2008
On Complexity Classes of Spiking Neural P Systems
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas
- Petr Sosík
- Ludek Cienciala
Eighth Brainstorming Week On Membrane Computing (p. 267-282) - 1/1/2010
- iMarina
Self-adapting intelligent neural systems using evolutionary techniques
- Manrique D
- Ríos J
- Rodríguez-Patón A
Artificial Neural Networks In Real-Life Applications (p. 94-115) - 1/12/2005
A Parallel DNA Algorithm Using a Microfluidic Device to Build Scheduling Grids
- García-Arnau M
- Manrique D
- Rodríguez-Patón A
Lecture Notes In Computer Science (p. 193-202) - 18/6/2007
- ISSN 03029743
- iMarina
A Preliminary Assessment of Three Strategies for the Agent-Based Modeling of Bacterial Conjugation
- García A
- Rodríguez-Patón A
A Preliminary Assessment Of Three Strategies For The Agent-Based Modeling Of Bacterial Conjugation (p. 1-9) - 19/5/2015
10.1007/978-3-319-19776-0_1 View at source
- ISSN 21945357
- iMarina
- iMarina
A new class of symbolic abstract neural nets: Tissue P systems
- MartÍn-Vide C
- Pazos J
- Păun G
- RodrÍguez-PatÓn A
Lecture Notes In Computer Science (p. 290-299) - 1/1/2002
- ISSN 03029743
- iMarina
A new model of synthetic genetic oscillator based on trans-acting repressor ribozyme
- Bueno J
- Rodríguez-Patón A
Lecture Notes In Computer Science (p. 1170-1177) - 1/1/2009
10.1007/978-3-642-02481-8_177 View at source
- ISSN 03029743
An auxin hormone - signaling factors oscillator regulates time-dependent branching in the Arabidopsis root
- Marcos Rodriguez
- Juan Perianez-Rodriguez
- Juan Carlos del Pozo
- Angela Saez
- SANCHEZ CORRIONERO, ALVARO
- BUSTILLO AVENDAÑO, ESTEFANO
- MORENO RISUEÑO, MIGUEL ANGEL
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Libro De Resumenes Del Xv Simposio De Fitohormonas De La Sociedad Española De Fisiología Vegetal (p. 28-28) - 13/12/2018
- iMarina
Autonomous resolution based on DNA strand displacement
- Sosik, Petr
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Lecture Notes In Computer Science (p. 190-203) - 29/9/2011
10.1007/978-3-642-23638-9_16 View at source
- ISSN 03029743
- iMarina
- iMarina
BactoSim - An Individual-Based Simulation Environment for Bacterial Conjugation
- Prestes Garcia, Antonio
- Rodriguez-Paton, Alfonso;
Bactosim ? An Individual-Based Simulation Environment For Bacterial Conjugation (p. 275-279) - 3/6/2015
10.1007/978-3-319-18944-4_26 View at source
- ISSN 03029743
- iMarina
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BioBlocks :A web-based visual environment for programming experimental protocols in biological sciences
- Jesus Irimia
- Gupta, Vishal
- PAU DE LA CRUZ, IVAN
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE
Proceedings Of The 8th International Workshop On Bio-Design Automation (p. 29-30) - 16/8/2016
- iMarina
Biochemical Signaling: a discrete simulation with Memory Enhancement
- Paun A
- Paun M
- Rodriguez-Paton A
- Jack J
Ieee 1st International Conference On Computational Advances In Bio And Medical Sciences, Iccabs 2011, (p. 257-257) - 3/2/2011
10.1109/iccabs.2011.5729910 View at source
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This researcher has no technical reports.
APLICACIÓN DE TÉCNICAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL Y DE APRENDIZAJE AUTOMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE DATOS DE LA EMPRESA NEO SOLUCIONES INFORMÁTICAS SL
- GARCIA CUESTA, ESTEBAN (Colaborador/a)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 06-04-2022 - 24-07-2022
Type of funding: Internal
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BACTOCOM: Bacterial Computing with Engineered Populations.
- MIRO BUENO, JESUS MARIA (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- Sosik, Petr (Participante)
- GOMEZ ESTEBAN, PABLO (Participante)
Period: 01-02-2010 - 31-07-2013
Type of funding: International
Amount of funding: 240918,00 Euros.
- iMarina
Desarrollo de aplicaciones de la computación celular con membranas y la computación biomolecular en la biología
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 01-10-2006 - 31-12-2009
Type of funding: National
- iMarina
Descifrando las infecciones bacterianas con técnicas de inteligencia artificial e ingeniería de biocircuitos
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- Mitrana, Victor (Participante)
- SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- LEON PRIETO, LUCIA (Miembro del equipo de trabajo)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
Period: 01-09-2023 - 31-08-2026
Type of funding: National
- iMarina
EVOlutionary PROgrammable antiBIOTICS
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
Period: 01-03-2014 - 28-02-2017
Type of funding: National
Amount of funding: 20862,00 Euros.
- iMarina
Engineering multicellular biocircuits: programming cell-cell communication using plasmids as wires
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Maojo García, Víctor Manuel (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
- Sosik, Petr (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- GREGORIO GODOY, PAULA (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- Molina González, Martín (Participante)
Period: 01-10-2013 - 30-09-2016
Type of funding: International
Amount of funding: 570600,00 Euros.
- iMarina
General-Purpose Programmable Evolution Machine on a Chip
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- González Martínez, Ángel Lucas (Participante)
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PEREZ PEREZ, AURORA (Participante)
- Gupta, Vishal (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Period: 01-10-2013 - 30-09-2016
Type of funding: International
Amount of funding: 381795,00 Euros.
- iMarina
Hacia la Inteligencia Artificial in vivo: programación de fármacos multicelulares vivos inteligentes
- LOPEZ-MAROTO QUIÑONES, ALVARO (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Miembro del equipo de trabajo)
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- Zeng NA, Xiangxiang (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- SONG, TAO (Participante)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- Fuertes Castro, José Luis (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- Mitrana, Victor (Participante)
Period: 01-06-2020 - 31-05-2023
Type of funding: National
Amount of funding: 87120,00 Euros.
- iMarina
Ingeniería de biocircuitos programables para computación analógica, multicelular y espacial
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Miembro del equipo de trabajo)
- HECTOR NIETO, MARIA ELENA (Miembro del equipo de trabajo)
- MARTINEZ CASTELLANO, EDUARDO (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Miembro del equipo de trabajo)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- MANRIQUE GAMO, DANIEL (Participante)
- PAUN, PAUL ANDREI (Participante)
- BARREIRO SORRIVAS, JOSE MARIA (Participante)
- GAGO GARCIA, ESTHER (Participante)
- PAU DE LA CRUZ, IVAN (Participante)
Period: 30-12-2016 - 29-12-2020
Type of funding: National
Amount of funding: 90387,00 Euros.
- iMarina
LIA. Ingeniería microbiana, salud y calidad de vida.
- MÉNDEZ MERINO, DAVID (Participante)
- RODRIGUEZ-PATON ARADAS, ALFONSO VICENTE (Investigador principal (IP))
- SONG, TAO (Participante)
- RODRIGUEZ REGUEIRA, MARCOS (Participante)
- NUÑEZ BERRUECO, ELENA (Participante)
- ZENG, XIANGXIANG (Participante)
Period: 01-01-2018 - 30-06-2022
Type of funding: Regional
Amount of funding: 29881,60 Euros.
- iMarina
A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo
1/1/2017
- iMarina
An end-to-end solution for automation of biological protocols
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Gupta, Vishal
1/1/2017
- iMarina
Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Pérez Pérez, David
1/1/2016
- iMarina
Conditional plasmid conjugation as wiring for multicellular biocircuits: individual-based modeling and simulation
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Guillermo Pérez del Pulgar Frowein
1/1/2017
- iMarina
Inference Models in DNA Computing
- Alfonso Rodríguez-Patón Aradas (Director) Doctorando: Iñaki Sainz de Murieta Fuentes
1/1/2013
- iMarina
La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: MARTINEZ LUACES, Milton
1/1/2009
- iMarina
Modelado computacional de la autoorganización espacial generada por circuitos genéticos multicelulares
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Rodríguez Regueira, Marcos
1/1/2021
- iMarina
Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director) Doctorando: Prestes García, Antonio
1/1/2017
- iMarina
Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator
- Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso (Director)
- PAZOS SIERRA, Juan (Director) Doctorando: Gregorio Godoy, Paula
1/1/2018
- iMarina
This researcher has no patents or software licenses.
Research groups
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Grupo de Inteligencia Artificial (LIA)
Role: Investigador Principal
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